Полный список научных трудов Д.К. Заболотного на русском, украинском и других языках насчитывает свыше двухсот названий. С основными из них, самыми главными, можно познакомиться по двухтомному изданию:

Д.К. ЗАБОЛОТНЫИ, Избранные труды. Киев, 1956–1957.

Из литературы о Заболотном особенно обстоятельны по материалу и интересны следующие книги:

Я.К. ГИММЕЛЬФАРБ и К.М. ГРОДСКИИ, Д.К. Заболотный — в серии «Выдающиеся деятели отечественной медицины». Москва, 1958.

К этой монографии приложены очень интересные воспоминания о Заболотном его товарищей и учеников.

Д.I. РУММ ЕЛЬ, Академiк Заболотний. Киiв, 1950. (На украинском языке.)

Г.М. ВАЙНДРАХ, Подвиги русских врачей. Москва, 1959.

А. ШАРОВ, Жизнь побеждает. Москва, 1951.

Л.А. ЛIБЕРМАН и М.В. СТАДНИЧЕНКО, Життевий шлях Данила Кириловича Заболотного. (Бiографiчний нарис.) «Мiкробiологiчний журнал» № 7 за 1940 год (на украинском языке).