Происхождение слова атаман, как и многих Других названий в русском языке, остается до сих пор вопросом без ответа. Русские историки пo установившемуся обычаю, имели всегда склонность неизвестные события русской истории объяснять заимствованием у своих соседей — германцев. Слово атаман они так же объясняли заимствованным у германских разбойничьих отрядов, в древности делавших пиратские нападения на западно–европейские побережья. Главари этих ватаг назывались «ваттманы», отсюда русскими исследователями сделано заключение, что атаман казаков — это заимствованное слово у германцев — ваттман. Объяснение это принималось без учета связи во времени и места этих двух событий. Казаки на русской территории зарождались в условиях монгольского владычества, где никакого влияния германцев быть не могло. Кроме того, время зарождения казачества относится к 13–14 столетиям, когда в Западной Европе о норманнских пиратах и германских вождях «ваттманах» не было уже и помина. Поэтому искать связь между двумя событиями, разделенными во времени двумя столетиями, — нет никаких оснований.

Исследования современных историков о происхождении слова атаман дают совершенно новое объяснение и производят его от монгольского слова, существовавшего в их военном обиходе — отец–командир.

В основе внутренней организации монгольских улусов существовал родовой патриархальный строй. Власть в улусах преемственно переходила от отца к сыну или старшему в роде. Преемственность эта нередко нарушалась насильственными переворотами, но порядок этот оставался неизменным. Военная организация в улусах представляла форму племенных или дружинных объединений. Во главе улусов стояли ханы, но главными военачальниками при них были темники. Темники, как высшие военачальники, делившие участь с подвластными им войсками в походах и боях, назывались отцы–командиры, слово понятное для войсковых соединений всех народов.

Военачальники поселений «Ордынской Руси» или подвластных монголам казачьих войск, не носили титулов монголо–тюркских начальников: князей, беков, а назывались воеводами, сотниками и урядниками. Высшие командные должности в казачьих войсках занимались монголами и главным военным лицом являлся темник. Современные исследования слова атаман производят от соединения двух монгольских, слов: ата — батя или отец и темен — или темник. Из соединения этих слов происходило название — атта–мен — означавшее отец–темник. Среди вооруженных сил «Ордынской Руси» наряду с национальными названиями военачальников, постепенно усваивалось и название высшего начальника ата–темена, что в несколько измененной форме, превратилось в атаман. («Энциклопедия русского языка». Горячев)

Таким образом, название атаман в казачьем, быту появилось со времени их зарождения под властью монгол и прочно укрепилось в их быту и сохранилось на все время их исторического существования. То же происхождение имело и название гетман, с некоторым изменением в произношении, в связи с местным наречием.