В 1963 г. с отличием окончил юридический факультет КазГУ им. С. М. Кирова (г. Алма-Ата).

В 1973 г. защитил кандидатскую диссертацию на тему «Управление материально-техническим снабжением промышленности». В 1997 г. ему присуждена ученая степень доктора юридических наук после защиты докторской диссертации на тему «Правовые формы финансовой деятельности государства». В 1998 г. А. И. Худякову присвоено ученое звание профессора.

С марта 1971 г. по февраль 1998 г. работал на юридическом факультете КазГУ в качестве старшего преподавателя, доцента, профессора, заведующего кафедрой финансового и налогового права.

С марта 1998 г. по 2009 г. жил в Санкт-Петербурге, где работал в должности проректора по учебно-методической работе Санкт-Петербургского института права.

С 1990 г. по 1997 г. был консультантом Парламента Республики Казахстан, членом научно-консультационных советов при Министерстве юстиции РК, Государственном арбитраже РК, Госстрахнадзоре РК, являлся разработчиком свыше 60 законопроектов, членом Конституционной комиссии Республики Казахстан, был разработчиком ряда проектов законов Российской Федерации и субъектов Российской Федерации.

А. И. Худяков – автор свыше 130 научных работ, включая 30 книг, учебников и монографий.

Принимал участие в разработке свыше 60 законов Республики Казахстан по экономическим и финансовым вопросам, включая Налоговый кодекс, Гражданский кодекс, законы «О защите и поддержке частного предпринимательства», «О бюджетной системе», указы Президента Республики Казахстан, имеющие силу закона: «О налогах и других обязательных платежах в бюджет», «О страховании», «О земле», «О недрах и недропользовании» и др., а также проекты законов Российской Федерации «Об обязательном страховании гражданской ответственности владельцев транспортных средств», «О недрах», 18 проектов законов субъектов Российской Федерации.