Еще с лета 1942 года в осажденном Ленинграде проходили выставки «Великая Отечественная война советского народа против немецких захватчиков». Сохранению для истории подлинных реликвий героической борьбы защитников дальних и ближних подступов к Ленинграду способствовал приказ Военного Совета Ленинградского фронта № 18 от 8 августа 1943 года «О сборе, учете и сохранении мемориальных образцов оружия и боевой техники», подписанный командующим фронтом Л. А. Говоровым и членами Военного Совета А. А. Ждановым и А. А. Кузнецовым.

После решения Военного совета фронта от 4 декабря 1943 года «Об организации выставки „Героическая оборона Ленинграда“» благодаря энергичной работе организатора выставки, лектора Политуправления фронта майора Л. Л. Ракова, она открылась 30 апреля 1944 года в Соляном городке на Рыночной улице, в сотне метров от Пантелеймоновской церкви, которую часто именуют Гангутской. В ноябре 1945 года на базе этой выставки был образован Музей обороны Ленинграда, имевший 37 залов общей площадью около 40 000 м2; директором его стал Л. Л. Раков. В экспозиции музея нашла свое отражение и оборона полуострова Ханко.

В 1946 году на улице Пестеля (ныне ей возвращено историческое имя Пантелеймоновская) во время ремонта пострадавшего в годы войны дома № 11 его торцевая стена, по проекту архитектора А. А. Лейман, была оформлена как мемориальная доска с текстом:

Слава великому советскому народу!

Доска воздвигнута в честь героической обороны полуострова Ханко (22 июня — 2 декабря 1941 г.) в Великой Отечественной войне 1941–1945 гг.

Слава мужественным защитникам полуострова Ханко!

Память о гангутцах была еще раз увековечена в 1950 году, когда Рыночную улицу переименовали в Гангутскую. Но еще в 1949 году доступ посетителей в Музей обороны Ленинграда под предлогом реконструкции был прекращен, а в октябре 1952 года музей, став жертвой печально известного «ленинградского дела», был ликвидирован.

Шло время. В начале 1970-х годов по инициативе ветеранов-ханковцев С. И. Кабанова, М. А. Дудина, Н. И. Теумина и многих других началась широкая кампания по созданию мемориальной экспозиции, посвященной обороне полуострова Ханко. Музей был создан в средней школе № 224 Фрунзенского района Ленинграда. Там неоднократно встречались и проводили экскурсии ветераны обороны. В настоящее время этот музей, постоянно пополняющийся новыми экспонатами, находится в средней школе № 368 на улице Ярослава Гашека в Санкт-Петербурге.

Пантелеймоновская церковь действовала как приходская до 1935 года, потом в ней находились склады различных организаций, а до 1979 года располагался цех по окраске тканей. Благодаря энергичной деятельности директора Государственного музея истории Ленинграда Л. Н. Беловой весной 1979 года Исполком Ленгорсовета принял решение о передаче здания церкви музею города для создания филиала «Гангутский мемориал», в экспозиции которого должны были быть отражены победы российского флота при Гангуте (1714 год), у острова Гренгам (1720 год) и оборона полуострова Ханко (1941 год).

6 декабря 1981 года в Пантелеймоновской церкви открылась выставка «164 огненных дня» — составная часть экспозиции будущего музея «Гангутский мемориал». Большой вклад в создание объемной экспозиции внесли заведующий филиалом В. С. Копельман, научные сотрудники Е. П. Перовский, С. В. Лебедев, сотрудники других музеев, художники, архитекторы.

8 апреля 1989 года Исполком Ленгорсовета принял решение о восстановлении Музея обороны Ленинграда в том же месте, где он и был, в Соляном городке. К сожалению, теперь музей занимает только один зал площадью 680 м2, а почти все экспонаты прежнего музея были утрачены. Вскоре и «Гангутский мемориал» стал филиалом Музея обороны Ленинграда.

Но шли годы, менялся и состав научных сотрудников «Гангутского мемориала» и органов управления музеями города. И в сентябре 1995 года «общими усилиями» Комитета по культуре при Мэрии Санкт-Петербурга и научных сотрудников выставки «164 огненных дня», музей-филиал, существовавший только юридически (хотя был выполнен значительный объем архитектурно-проектных работ и изготовлена часть экспонатов) был ликвидирован.

Отдельные небольшие фрагменты выставки сохранились в Музее обороны и блокады Ленинграда, часть экспонатов и документов была утрачена, некоторые экспонаты удалось, благодаря усилиям ветеранов-ханковцев и директора финского «Фронто-музее» (в Лаппохья на полуострове Ханко) Стига Хаггстрема, разместить в этом музее. В 1997 году был установлен памятный знак на острове Хорсен, в 1998 году — памятная доска на здании маяка Бенгтшер. В июле 2001 года ветераны-ханковцы возложили венки у памятника в Риилахти и обелиска в Тяктоме, пригороде Ханко.

Сейчас, когда Санкт-Петербург отмечает свое 300-летие, есть все основания для возрождения «Гангутского мемориала» как филиала Музея обороны и блокады Ленинграда.