Хребет Мушкетова — Тянь-Шань, Центральная Азия.

Вулкан Мушкетова — Витимское плоскогорье, верховья р. Витим.

Ледник Мушкетова — на северо-западе о-ва Большевик архипелага Северная Земля.

Ледник Мушкетова — район пика Хан-Тенгри в Тянь-Шане.

Ледник Мушкетова — Гиссарскйй хребет, на северном склоне хр. Академии Наук.

Ледник Мушкетова — хр. Кок-Шаал-Тау в Тянь-Шане.

Ледник Мушкетова — хр. Каратегин, верховья р. Нам-Неруда.

Ледник Мушкетова — Восточная Антарктида, к северо-западу от Русских гор, на берегу Астрид.

Пролив Мушкетова — между о-вом Гаврилова и п-вом Заря берега Харитона Лаптева на п-ве Таймыр.

Станция Мушкетова — Южно-Донецкая железная дорога.

Мушкетовская шахта — в Донецком бассейне.

Мушкетова улица — в ст. Алексеевской Волгоградской области, где родился И. В. Мушкетов.

Мушкетова И. В., им. — средняя школа в ст. Алексеевской Волгоградской области.

Мушкетода И. В. им. — районная библиотека в ст. Алексеевской Волгоградской области.

Мушкетовит — минерал, представляющий псевдоморфозы магнетита по пластинчатым кристаллам гематита.

Мушкетовский источник — выход минеральной воды в Ессентуках, вскрытой И. В. Мушкетовым.