Джунгары поддерживали тибетский буддизм в северной части Восточного Туркестана и в восточной части Казахстана с конца XVI столетия, до того как потерпели поражение и были практически полностью истреблены манчжурами в середине XVIII столетия. Калмыки откололись от джунгаров в начале XVII века, отправившись в район Волги, в европейскую часть России. Часть их вернулась в Восточный Туркестан в конце XIII века, где с тех пор живет и следует тибетскому буддизму. Тем не менее, до нахлынувшего в наши дни потока китайских переселенцев народностей хань и хуэй, подавляющее большинство жителей Восточного Туркестана составляли уйгуры, исповедующие ислам.
[Подробнее см.: Историческое взаимодействие буддийской и исламской культур до возникновения Монгольской империи.]