Несколько ближайших учеников Цонкапы основали монастыри, чтобы продолжить его традиции и распространить его учения. Пока Цонкапа был ещё жив, Джамьянг Чодже (‘Jam-dbyangs Chos-rje bKra-shis dpal-ldan) (1379-1449) в 1416 году основал монастырь Дрепунг (‘Bras-spungs dGon-pa), а в 1419 году Джамчен Чодже (Byams-chen Chos-rje Shakya ye-shes) (1354-1435) основал монастырь Сера (Se-ra dGon-pa). После ухода Цонкапы Гью Шераб Сенгге (rGyud Shes-rab seng-ge) (1383-1445) в 1433 году основал Нижний тантрический колледж Гьюме (rGyud-smad Grva-tshang), а в 1447 году Гьелва Гендун Друб (rGyal-ba Ge-’dun grub) (1391-1474), посмертно названный Первым Далай-ламой, основал монастырь Ташилхунпо (bKra-shis lhun-po).