Следующей большой тюркской группой, которая приняла буддизм, были древние тюрки (гоктюрки), давшие название тюркским народам. Восточный Тюркский каганат правил Монголией с конца VI до середины VIII века. Под покровительством его правителей индийские, центральноазиатские и китайские мастера перевели множество буддийских священных писаний на древнетюркский язык. Некоторые древнетюркские технические буддийские термины стали общепринятыми в Центральной Азии и позже были позаимствованы уйгурами и монголами. Древние тюрки привнесли в свою форму буддизма поклонение традиционным древним тюркским богам, или «тенгри», а также зароастрийским богам, о которых они узнали от других центральноазиатских народов. Эта эклектичная черта была унаследована и продолжена уйгурами и монголами. В начале VIII века принцесса из восточно-тюркской царской семьи вышла замуж за императора Тибета и, благодаря ей, в Тибет было приглашено много буддийских монахов из Хотана – царства, располагавшегося на юге Восточного Туркестана.

Западный Тюркский каганат также оказывал значительное покровительство буддизму с начала VII до начала VIII века. На территории Узбекистана правители Западного Тюркского каганата построили новые монастыри. Распространение буддизма на территории Киргизии и юго-восточного Казахстана в период с конца VII до начала VIII веков произошло благодаря одной из ветвей западных тюрок – тюргешским племенам. Тюргеши также были союзниками Тибетской империи.

В начале VII столетия место тюргешских племен в Киргизии и Казахстане заняли карлуки – восточное тюркское племя, тоже избравшее буддизм и также ставшее союзником тибетцев. В середине IX века одна из ветвей карлуков – караханиды – основала царство на территории восточной Киргизии и кашгарского региона юго-западной части Восточного Туркестана. Более века караханиды следовали смеси кашгарского буддизма и их собственного шаманизма.