В 1905 году «Союз освобождения», в котором состоял Вернадский, примкнул к партии кадетов. Вернадский вместе со своими друзьями Корниловым и Шаховским были избраны в Московский и Центральный комитеты. Председателем партии стал Петрункевич.

Гостеприимная квартира Вернадских стала штабом для «кадетского братства». Наталья Егоровна была радушной хозяйкой, у которой всегда был обед для гостя, хотя она тоже была активным членом партии. Ее выбрали секретарем Московского городского комитета. Она разрывалась между своими рабочими обязанностями и домохозяйством, и ей в помощники отрядили Георгия, который тогда уже был студентом университета.

В. И. Вернадский, профессор Императорского Московского университета. 1906 год.

Несмотря на всеобщий кавардак, Вернадский продолжал жить по расписанию. Наталья Егоровна хранила неприкосновенность его кабинета. Владимир стал помощником ректора Московского университета. У него было около тысячи подчиненных по всей Москве. Владимир нес эту ответственность полгода.

Несмотря на интенсивность общественной и политической деятельности в том году, Вернадский не забросил науку. Выходили его статьи по минералогии и кристаллографии. Он работал у себя в кабинете каждый день.

В феврале 1906 года Вернадскому предложили баллотироваться в Академию наук. Он согласился, так как рассчитывал, что тогда сможет приблизить свою область науки – минералогию – к реальной жизни, сможет извлечь из нее практическую пользу для страны. Единственным его условием было не уезжать окончательно из Москвы. Вернадский планировал продолжить преподавать и заведовать геологическим музеем. Он стал адъюнктом по минералогии Санкт-Петербургской академии наук.

27 апреля 1906 года в Зимнем дворце Вернадский присутствовал по правую руку от трона в Георгиевском зале по случаю торжественного провозглашения царем нового государственного строя – монархии, ограниченной парламентом.

Вернадский был настроен крайне оптимистично по этому поводу. Верил, что наступила новая демократия, которой теперь уже не будет конца, раз она началась.

Вернадский стал членом Государственного совета. Он выдвигался от академической курии. Когда Вернадский приходил на заседания, им овладевала тоска. Ничего не изменилось: члены совета все так же не заботились о государственных делах, ими двигало желание добиться больших привилегий для себя и своих родственников. Он писал жене: «Вчера было заседание прогрессивных членов Государственного совета выборных и назначенных. Впечатление очень тяжелое и безнадежное. И безнадежное с двух сторон – с одной стороны в смысле необычайно малой умственной силы, а с другой – и потому, что ведь это цвет Государственного совета! Мы почти наверно отделимся от них, и это вырешится сегодня, так как мы будем проводить наши взгляды до конца».

Вернадский с первого же заседания начал активно отстаивать отмену смертной казни. Он написал статью о смертной казни в газету «Речь»: «Сотни казней, сотни легально и безнаказанно убитых людей в течение немногих месяцев, в XX веке, в цивилизованной стране, в образованном обществе! Если бы нам сказали об этом как о возможном и вероятном несколько лет назад, мы сочли бы это дикой фантазией. Когда в некоторых кругах русского общества перед наступлением революции носился страх ее кровавых дел, – этот страх обращался в сторону революционеров. Революция пришла, и оказалось, что правительственная власть стоит далеко впереди их, что на ее совести несравненно больше крови и больше убийств. И занесенная кровавая рука власти не останавливается. Правительственный террор становится все более кровавым. Это орудие должно быть отнято у власти. Смертная казнь должна быть бесповоротно и окончательно отменена. В защиту ее не слышно никаких разумных доводов, ее сторонники молчат – в них говорит лишь чувство отмщения и возмездия, лишь рутина и умственная беспомощность».

Вернадский среди членов Государственного совета.

9 июля 1906 года Столыпин, который когда-то учился в университете одновременно с Вернадским, стал председателем совета министров. Столыпин всегда был против Государственной думы, считал ее революционным началом. И вот первый состав Думы распущен. «Факт свершился – надо ждать последствий, – с мрачным предвкушением писал Вернадский жене. – Насколько могу видеть положение дел – это акт безумия и самоубийства». Принятие решения об отмене смертной казни было заморожено.

В Полтаве. Слева направо: Георгий Вернадский, дядя – Павел Егорович Старицкий, мать – Наталья Егоровна, сестра Нина, отец Владимир Иванович Вернадский. 1908 год.

11 июля он писал жене: «Я думаю, что теперь начнется борьба, которая в конце может вызвать гораздо более коренное изменение строя России, чем предвиделось несколько недель назад. Сделано это, я думаю, по невежеству и полному отсутствию государственного смысла. Столыпин нанес монархии или по крайней мере династии более сильный удар, чем все революционеры вместе взятые».

Кадеты написали обращение «Народу от народных представителей». Автором был Милюков, но редактурой занимались все лидеры кадетов, включая Вернадского. Они призывали народ не платить налоги, а военных не служить в армии, чтобы правительство их наконец услышало. Только потом Вернадский понял, что это была одна из самых больших ошибок партии. Всех, кто подписал обращение, судили. Им запретили баллотироваться в Думу следующего созыва. Таким образом, во вторую Думу попали личности куда слабее тех, что были в первой.

Вернадский никогда не мог полностью посвятить себя общественной и политической жизни. Главной оставалась наука. Летом 1907 года отправился на исследования в Фенноскандию и впервые выразил идею биосферы. Он писал жене свои впечатления от поездки: «Чрезвычайно характерна картина Финляндии, по которой проехал. Страна сглажена ледником до плоскости, скалы не возвышаются, а составляют ровное дно. На них жалкие деревья, с огромным трудом удобренные поля, и всюду болотистая торфяная земля. Реки и ручьи несут в море темную воду. И я ярко впервые пластически понял, какое колоссальное количество органического вещества уносится в море этими водами – это все продукт энергии организмов, который меня интересует в данное время. Роль их в жизни Земли гораздо значительнее, чем раньше предполагалось».

В 1908 году он стал экстраординарным академиком. Летом отправился отдохнуть во Францию с женой и дочерью Ниной. Но и во время отдыха не ослабевала его научная деятельность. Вернадский пришел к понимаю термина живого вещества, которым будет оперировать в своей работе до конца жизни.