Пока Александр занимался изучением наук и постигал основы государственного управления, его отец продолжал свою упорную работу по возвышению Македонского царства. В 353–352 гг. до н. э. произошло первое открытое вмешательство Филиппа в дела Греции – во время так называемой Священной войны (355–346 гг. до н. э.). Предыстория этой войны довольно запутанна и уходит своими корнями ко времени фиванского и спартанского противостояния. А сигналом к началу боевых действий послужил захват горным племенем фокейцев храма Аполлона в Дельфах – общеэллинского святилища. Помимо собственно храма были захвачены огромные сокровища и на эти деньги стратеги фокейцев, сначала Филомел, а после его гибели Ономарх, создали сильную и боеспособную армию. Однако стратеги оказались не только хорошими организаторами, но и толковыми полководцами и начали громить на полях сражений войска коалиции, которую против них создали беотийцы. Фокейцев поддержали Афины и Спарта, а беотийцев локры и фессалийцы. Боевые действия велись по всей Центральной Греции и в итоге затронули Фессалию – а фессалийцы находились в зависимости от Македонии, а значит, это уже напрямую затрагивало интересы царя Филиппа. Македонский царь быстро сообразил, какие заманчивые перспективы открывает перед ним возможность вмешательства в греческие дела, и когда последовал призыв фессалийцев о помощи, он охотно на него откликнулся.

Македонская армия вступила на территорию Фессалии и атаковала город Феры, тиран которого, Ликофрон, поддерживал фокейцев. На помощь тирану из Фокиды подошли войска под командованием Фаилла, брата главного стратега Ономарха, но македонские ветераны разгромили их наголову и изгнали из Фессалии. Вот тогда и явилась из Фокиды основная армия во главе с самим стратегом, и в двух сражениях Ономарх нанес Филиппу поражение. Фокеец оказался талантливым командиром и храбрым человеком, его войска не испугались страшной македонской фаланги и, нанеся своему противнику тяжелые потери, заставили Филиппа уйти в Македонию. Избавившись от главного врага, победоносный Ономарх вторгся в самое сердце вражеской коалиции, в Беотию, и захватил город Коронею.

Однако македонский царь и не собирался сдаваться – неудачи заставляли его действовать еще энергичнее. Пополнив свои войска и подняв их боевой дух, он вновь вступил в Фессалию и осадил Феры. Тиран Ликофрон, понимая, что в одиночку он не выстоит, снова обратился к Ономарху за помощью. Грозный фокеец вновь откликнулся на его призыв и привел на помощь 20 000 пехоты и 500 всадников. Но и Филипп сделал выводы из предыдущей неудачи и выставил против врага 20 000 пехотинцев и 3000 кавалерии, большую часть которой составляли поддержавшие его фессалийцы. В яростной битве на Крокусском поле, Филипп полностью разгромил фокейцев, устроив беспощадную резню бегущих – 6000 их было убито, а 3000 попало в плен. С пленными царь жестоко расправился – как осквернителей храма их утопили в море, а храброго Ономарха по царскому приказу повесили.

После этой победы македонская армия заняла Феры и уничтожила тиранию, а Филипп, наведя порядок в Фессалии, выступил в поход на Фокиду. Но неожиданную прыть проявили афиняне – их армия заняла Фермопилы и преградила путь победоносному македонскому царю. Начинать боевые действия против Афин Филипп не хотел, а потому развернул войска и ушел в Македонию: « увеличив свое царство не только своими достижениями, но и своим почтением к богу » (Диодор).