В течение первого года после принятия на вооружение производство и ремонт «Ланкастеров» зависели исключительно от поставок фирмой Роллс-Ройс двигателей «Мерлин», производственные возможности которой ограничивали поставки цифрой 18000 моторов в год. Опасаясь возможной нехватки английское правительство заключило с американской фирмой Паккард соглашение о лицензионном производстве «Мерлинов». Следует отметить, что еще до создания «Ланкастера» Роллс-Ройс обсуждала возможность такого соглашения с Форд Моторс Компани и первые партии технической документации на двигатель были отправлены в США еще до капитуляции Франции. Несмотря на опасения англичан, Паккрд сумела за год наладить серийный выпуск моторов.
В английских ВВС этот двигатель получил обозначение «Мерлин» 28, а в американских- Паккард V-1650-1. Фирма выпускала мотор с двухступенчатым нагнетателем, способный развивать взлетную мощность 1420 л.с. Первоначально предусматривалось, что английский и американский двигатели будут абсолютно идентичны по конструкции, но задержки с поставками комплектующих привели к тому, что Паккард стала устанавливать на свои изделия американские магнето и карбюраторы Бендикс.
«Ланкастер» CF-X/LM384 из 625-й эскадрильи был одним из последних самолетов, поступивших в войска без установленного на заводе радара H2S. Снимок сделан в декабре 1943, этот бомбардировщик пропал без вести ночью 19/20 февраля 1944 года во время налета на Лейпциг, когда Люфтваффе подняли в воздух около 300 ночных истребителей. На свои базы в тот раз не вернулись 78 английских бомбардировщиков.
H2S
«Ланкастер» ND787 из 49-й эскадрильи сфотографирован на аэродроме Файскертон в середине 1944 года. Машина оснащена радаром H2S, установленном в обтекателе под хвостовой частью фюзеляжа.
Производство «Ланкастеров» шло столь высокими темпами, что английские и американские двигатели устанавливались на самолеты сразу по мере поступления. Самолеты с американскими моторами получили обозначение «Ланкастер» В. Mk III. Внешне эти машины ничем не отличались от Mk I, и когда капоты двигателей были закрыты, определить модификацию самолета можно было лишь по серийному номеру, сверившись с заводской документацией. И Mk I и Mk III сходили с одних и тех же сборочных линий, в одно и то же время. Mk I превращался в Mk III простой заменой двигателей, и наоборот. Иногда, после ремонта, самолет мог летать с двумя английскими и двумя американскими моторами.
Первые испытания моторов Паккард прошли в конце 1942 года на самолетах с серийными номерами R5849 и W4114, а в серии они стали устанавливаться с середины 1943 года, первым стал «Ланкастер» W4983. Хотя механически английские и американские «Мерлины» были взаимозаменяем, они имели разные эксплуатационные особенности, что затрудняло их одновременное использование на уровне эскадрилий. Двигатели Паккард, благодаря карбюратору Стормберг, имели лучшие взлетные характеристики, но, одновременно, имели склонность перегреваться при взлете и посадке. Поэтому в летных школах Бомбардировочного Командования, где самолеты преимущественно эксплуатировались в режиме взлет-посадка, предпочитали использовать Mk I с моторами английского производства. Первые «Ланкастеры» В. Mk III стали поступать на вооружение эскадрилий в декабре 1943 года.