Боевой опыт применения самолетов Ju 88А-4 'I гор показал необходимость выпуска малой серии торпедоносцев, обозначенных как Ju 88А-17. На самолетах этого типа не было подкабинной гондолы. На некоторых самолетах серии устанавливали морской радиолокатор FuG 200 HohenUveil.

Самолет Ju 88 А-17 использовали в некоторых боевых частях, в том числе в KG 26, 76 и KueFlGr 506.