В разных источниках, посвященных данному вопросу, встречаются разногласия относительно того, какой самолет носил обозначение Ju 88С-7. Чаще всею говорят, что Ju 88С-7 представлял собой С-6, с которого было снято радиолокационное оборудование, поскольку данную версию использовали в качестве дневного истребителя. Сообщается, что Ju 88С-7 – был самолетом с улучшенной аэродинамикой. Наконец, выдвигалось предположение, что Ju 88С-7 был оснащен, как и Ju 88С-5, подфюзеляжной гондолой, в которой располагались две пушки MG FF калибра 20 мм и пулеметы MG 17.

Было выпущено всего несколько самолетов этой модификации. Известен самолет K9+VH, поднявшийся в воздух в июне 1942 года. На этом самолете стояли радиальные моторы BMW 801D с турбонаддувом GM 1.

Как и в случае с Ju 88С-6, машины типа Ju 88С-7 подразделяют на три класса: С-7а – с двигателями Jumo 221J-1, несущий 500 кг бомб, С-7Ь – с теми же двигателями, но с бомбонагрузкой 1500 кг и С-7с с радиальными двигателями BMW 801 МА.