Самолеты Ju 88А-2 в отличие от Ju 88А- 1 оснащались стартовыми ракетными ускорителями Walther Rb 202, которые сокращали разбег и облегчали взлет перегруженным самолетам. Ускорители крепили к крыльям самолета между фюзеляжем и мотогондолами. Отработанные ускорители сбрасывались на парашютах.

Восьмой из десяти предсерийных самолетов Ju-88A-O отличался четырехлопастными воздушными винтами. Самолет использовался Erprobungsstelle- 88 в Рехлине для испытаний.

Сборочная линия бомбардировщиков Ju-88A. Темп серийного производства наращивалось медленно – в 1939 г. люфтваффе получили всего порядка сотни бомбардировщиков. В последующие годы с разрешением конструкторско- технологических проблем темн производства значительно возрос. Помимо заводи фирмы Юнкерс в Бернбурге, самолеты Ju-88 строились еще на шести предприятиях по лицензии: на заводе фирмы Хейнкель в Ораниенбурге, заводе Аридо в Ораниенбурге, заводе А TG в Лейпциге, заводе фирмы Зибель в Пиле, на заводе фирмы Хеншель в Перлине и на заводе фирмы Дорнье в Висмаре. Объединенными усилиями авиастроительные фирмы Германии поставили люфтваффе в 1940 г. почти 2200 самолетов Ju-88. Своего пика серийный выпуск Ju-88 достиг в 1943 г., когда заводы АТС, Зибель, Хеншель и Юнкерс сдали более 3300 самолетов данного шипа. Всего было построено 14676 самолетов Ju-88 всех модификаций, включая прототипы.