В начале 1940 г ода фирма Юнкерс начала подготовку к выпуску новой модификации бомбардировщика Ju 88А-5. На этот самолет предполагали поставить двигатели Юнкерс Jumo 211F или 211.1 мощностью 1029 кВт/1400 л.с. Поскольку эти двигатели еще не были доведены, то RLM заказал Юнкерсу серию переходных самолетов Ju 88А-5. Прототипом этой серии был Ju 88V14 (D-APSF).
Фюзеляж Ju 88А-5 не отличался от фюзеляжа Ju 88A-I. зато крылья были взяты от Ju 88А-4. Вместо элеронов обтянутых тканью использовали металлические элероны. Было усиленно шасси. Самолеты Ju 88А-5 первых выпусков были вооружены единственным пулеметом, MG-15 калибра 7.92 мм установленным в верхней установке. Под крыльями Ju 88А-5 можно было установить дополнительный бомобдержатель ЕТС 250. позволявший подвешивать 250-кг бомбы. Самолеты были оборудованы идентификационным радиоустройством (IFF) FuG 25а Erstling радиусом действия 100 км. Изменился тип антенны и антенной мачты. Первые Ju 88А-5 (переделанные из поврежденных Ju 88A-I) были направлены в бомбардировочные части (главным образом KG 30) Люфтваффе в конце июля – начале июня 1940 года. По сравнению с Ju 88A-I, Ju 88А- 5 характеризовался лучшими летными качествами и был более маневренен. Постепенно Ju 88А-5 вытесняли прежнюю модификацию, кроме новых самолетов, переделке подвергались и старые Ju 88А-1.
В ходе серийного выпуска в конструкцию А-5 внесли много изменений. Вместо двигателей Jumo 211В, использованных на Ju 88A-I и первых Ju 88А-5, стали использовать новые Jumo 211G-1 или Jumo 211Н-1 мощностью 884 кВт/1200 л.с. Задняя пулеметная установка оснащалась двумя пулеметами MG 15 на лафетах Linselafette ZI0D. Кормовая верхняя установка была защищена броней. На самолетах Ju 88А-5 поздних выпусков использовали два типа установок Z10D с овальными и прямоугольными смотровыми отверстиями. На самолетах первых выпусков нижняя пулеметная установка была такой же. что и на А-1. позже ввели установку Bola (сокращение от Bodenlafette – нижняя пулеметная установка.) 39С или 39D VE с одним пулеметом MG 15. а несколько последних самолетов этой модификации оснащалось установкой Bola 81 со спаренным пулеметом Маузер MG 81Z калибра 7.92 мм. Установки Bola 39С и 39D VE отличались друг от друга способом крепления пулемета. Стоит добавить, что Bola 39D VE была приспособлена не только для MG 15, но и для MG 811 (MG 81Z) или MG 131. В полевых условиях на самолетах использовали и другие схемы вооружения.
Бомбардировщик Ju-88A-I из 1-й бомбардировочной эскадры. Эмблемой KG-1 являлся щит фельдмаршала Гинденбурга. Самолеты модификации «А-1» отличались от Ju-88A-( трехлопастными воздушными винтами. На Ju-88A-I стояли двигатели JUMO-211B-1.
Трое из четырех членов экипажа бомбардировщика Ju-88A-1 из KG-71 позируют фотографу, устроившемуся на месте бомбардира. Поражает теснота кабины – после такого кабину Ил-76 называть тесной? Между, тем, в кабине Ил-76 очень тесно, особенно в сравнении с кабиной Ан- 124, но это совсем другая история. Место пилота смещено влево от продольной оси самолета, бомбардир находится правее и ниже пилота. Борттехник размещается лицом к хвосту за пилотом, радист – ниже и правее борттехника.