Обвал финансирования оборонной промышленности сначала Советского Союза, а затем, по наследству, и России похоронил надежду на запуск в серийное производство самолетов МиГ-29М. Как менее дорогая альтернатива МиГ-29М в ОКБ была разработана модификация МиГ-29СМТ. МиГ- 29СМТ давал микояновцам шанс на выживание в условиях повального увлечения в верхах изделиями фирмы Су. Микояновский истребитель 5-го поколения «1.44» по непонятно-понятным причинам «завис», денег на МиГ-29М не выделялось, экспорту МиГ- 29, в отличие орт Су-27, на государственном уровне никто не способствовал, программу транспортного МиГ-110 «перебила» своим С-80 все та же фирма с улицы Поликарпова. В «изделии 9-17» была предпринята попытка интегрировать в планер старого МиГ-29 максимум наработок по МиГ- 29М. Пришлось пойти по пути, которого так хотел избежать Р. А. Беляков: растить «горб» и размещать в нем дополнительное топливо и электронику.
МиГ-29М позиционировался не только и даже не столько как истребитель воздушного боя. Микояновцы и дальновидные представители ВВС видели в нем самолет, способный заменить снятые но странным и надуманным предлогам с вооружения российских ВВС истребители-бомбардировщики МиГ-27 и Су-17. Острейшую нужду в таких машинах показала Чечня.
В вариант МиГ-29СМТ можно модернизировать ранее построенные варианты истребителя. Фактически самолет представляет собой сильно упрощенный МиГ-29М, но в отличие от «М» в кабине «СМТ» стоят цветные жидкокристаллические многофункциональные индикаторы – сказался прогресс в области электроники. Полностью обновлено навигационное оборудование – установлена инерциальная навигационная система с коррекцией по спутникам систем ГЛОНАСС и NAVSTAR. Электронный «борт» завязан на шину данных ставшего международным американского военного стандарта MIL-STD 1533.
В увеличенном гаргроте размещен дополнительный запас топлива. Суммарный запас топлива во внутренних баках на МиГ- 29СМТ составляет 4775 кг.
В качестве демонстратора использовался прототип МиГ-29СМ с бортовым номером «331» (ранее «405»). Частично доработанный в вариант СМТ путем замены приборного оборудования кабины самолет выполнил первый полет в новом качестве 29 ноября 1997 г. Позже на самолет был установлен гаргрот увеличенного объема. С новым гаргротом самолет выполнил первый полет 22 апреля 1998 г.
Первый самолет «изделие 9-17», соответствующий штатной комплектации, был переоборудован из МиГ-29СЭ борт «555» (заводской номер 4710), модернизированный самолет получил бортовой номер «917»; первый полет на нем совершил 14 июля 1998 г. летчик-испытатель Владимир Горбунов. В том же году машина демонстрировалась в Фарнборо.
В систему управления оружием истребителя-бомбардировщика МиГ-29СМТ интегрирована PJIM Н-019М, совместимая с системой управления ракет воздух – поверхность Х-31А и Х-35У. Практически, в ассортимент вооружения входят все управляемые ракеты (кроме используемых на стратегических ракетоносцах Ту-22МЗ, Ту- 95МС и Ту-160) и корректируемые бомбы российского производства.
Предполагалось, что модернизация «строевых» МиГ-29 в вариант «СМТ» начнется в 1999 г. с темпом 20 самолетов в год. Естественно, этого не произошло. В 2006 г. появились сообщения о планах ВВС начать модернизацию истребителей МиГ-29 в вариант МиГ- 29СМТ силами 121-го авиаремонтного завода в Кубинке. Не исключено, что принятию данного решения способствовали поставки самолетов МиГ-29СМТ на экспорт.