Среди работников Одесского городского комитета партии возникла идея провести подпольную общегородскую партийную конференцию. Соколовская была против. Она считала, что это может привести к ослаблению конспирации. Но под давлением большинства членов она согласилась, но с тем, чтобы на конференции не присутствовали некоторые работники, особенно те, кто был занят на военно-повстанческой работе. Елена решила участвовать в конференции, подготовила предложения.
Подпольная конференция Одесской организации КП(б)У состоялась 2-го ноября. Присутствовало 26 делегатов, представлявших 290 членов партии. Конференция обсудила вопросы: 1) Текущий момент, 2) Доклад Красного Креста.
Делегаты послали приветствие Красной Армии, в котором выражалась уверенность, что деникинские войска будут отброшены к берегам Черного моря.
Решения конференции определяли ближайшие задачи: дезорганизацией вражеского тыла облегчить положение борющихся советских братьев — русских рабочих и крестьян. Для этого необходимо усилить работу в деревне, объединить силы, выступающие против деникинцев, развить партизанскую войну с целью захвата власти и восстановления диктатуры пролетариата.
Конференция приняла решение о перестройке и усилении деятельности военного отдела, улучшении издания нелегальной литературы, о немедленной посылке работников в деревню, о проведении агитации в войсках деникинской армии.
— Словно крылья выросли,— говорили подпольщики после конференции.
Районные и общегородская партконференции, проведенные в условиях тяжелейшего подполья, избрание партийных комитетов — все это внесло новую живительную струю в деятельность коммунистического подполья. Заметно поднялась партийная работа на заводах и фабриках, в предместьях города и в уездах.
Зафронтовое бюро 19 ноября 1919 года направило в Центральный Комитет партии доклад, в котором сообщалось:
«Из Одессы в Киеве было два человека. Настроение самое отрадное. Имеют хорошую связь с предприятиями и селами. Руководит работой в области Елена».
Сама Соколовская во время деникинщины находилась в более глубоком подполье, чем в период англо-французской интервенции. Не случайно поэтому многие участники подполья узнали о том, что во главе подпольного губкома партии находилась Елена, только после изгнания белогвардейцев из Одессы.
Одесский общегородской комитет, избранный на партийной конференции 2 ноября, не смог развернуть свою деятельность. На четвертый день после конференции начались новые аресты. Деникинцы арестовали секретаря комитета Розу Лучанскую. В руки контрразведки попали некоторые документы и печать комитета. Причины провала не были установлены. Высказывалось мнение, что отдельные делегаты конференций были выслежены шпиками.
Над подпольной организацией большевиков нависла угроза провала. Елена Соколовская дала указание немедленно произвести смену паролей, явок, конспиративных квартир. Некоторым подпольщикам было предложено на несколько дней уйти в глубокое подполье. Наступили тревожные дни.
Агентам государственной стражи удалось напасть на след подпольщиков, охранявших арсенал в катакомбах. Несколько пулеметов, 200 винтовок и другое военное снаряжение оказалось в руках врага.
Репрессии продолжались. Но борьба против контрреволюционных сил нарастала.