В октябре 2005 г. на базе Эдвардс в торжественной обстановке состоялось прощание с третьим прототипом YF-117 (79-10782, «Скорпион-3»). 22 октября на самолете-ветеране выполнил полет командир 410-й летно-испытательной эскадрильи подполковник Син МакАллен, на следующий день – начальник штаба 410-й эскадрильи подполковник Дэйн Опелла. По случаю прощания с самолетом, все его нижние поверхности были окрашены в цвета флага США. Аналогичным образом был покрашен в декабре 1983 г. борт «783».

Третий прототип был задействован в различных программах летных испытаний. Так с марта по сентябрь 1993 г. он летал на оценку визуальной заметности, будучи перекрашенным в серый цвет в рамках программы «Evening Shade». В октябре самолет опять перекрасили в черный цвет, после чего он использовался для отработки перспективного электронного оборудования.

После церемонии прощания, «флаг» с нижних поверхностей самолета смыли. 10 ноября самолет официально передали для использования в качестве пособия для подготовки техников, но самый последний полет самолет выполнил 14 ноября 2005 г. на авиабазе Холломэн (летал шеф-пилот фирмы Локхид-Мартн Дэйв Кули). За все время эксплуатации «Скорпион» выполнил 1205 полетов и налетал 1535,5 часов. Эксплуатация четвертого и пятого YF-117А (борт «783» и борт «784») продолжается. Самолеты базируются на аэродроме фирмы Локхид-Мартн в Палмдейле, шт. Калифорния, но приписаны к 412- й летно-испытательной эскадрильи с базы ВВС Эдвардс.

Фюзеляж заканчивается двухкилевым вертикальным оперением. Кили установлены на фюзеляже на очень небольшом расстоянии друг от друга, что хорошо видно на этой сделанной сверху фотографии. Законцовка фюзеляжа между килями выполнена строй. Непосредственно перед килями расположен отсек тормозного парашюта.

Когда второй прототип YF-117А готовили к передаче в музей ВВС США с него удалили все радиопоглощающие покрытия, после чего «голую» обшивку окрасили в черный цвет. На снимке – кили самолета крупным планом после удаления РПМ.

Кили F-117A декорированы только снаружи, обычно маркировка выполняется краской светло-серого цвета (примерно FS36495). Самолет борт «819» (85-0819) принадлежал командиру 49-го тактического истребительного авиакрыла; крыло дислоцировалось на авиабазе Холломэн, шт. Нью-Мексико. В верхней части киля нанесено полноцветное изображение эмблемы тактического авиационного командования ВВС США. Самолет с собственным именем «Raven Beauty» в ходе «Бури в Пустыне» выполнил 30 боевых вылетов.

Руддерваторы F-117A (80-0790) из 415-й тактической истребительной эскадрильи немного отклонены вправо синхронно, как рули направления. Поверхности руддерваторов выполнены фасеточными, а линии стыка с основаниями килей – изломанными. «Найтхок» с собственным именем «DEADLY JESTER» входе «Бури в Пустыне» выполнил 30 боевых вылетов.