После смерти хана Абака Конаева во главе государства встал старший его сын Кока Абаков. Томские воеводы, узнав о смерти хана Абака, направляют в Теленгетское ханство свое посольство во главе с З. Амосовым, дав ему наказ: добиться во чтобы— то ни стало от хана Коки подтверждения обязательств военно-политического союза между Россией и Теленгетским ханством, заключенного ханом Абаком. Хан Кока при встрече с русскими послами заверил Российскую сторону о премственности им внешней политики и соблюдении договора о военно-политическом союзе заключенного его отцом с Россией в 1609 году. Посольство, посланное в Россию возглавляемое его братом Ильмесом, подтвердило в Томске действие договора о военно-политическом союзе между теленгетами и русскими.

Летом 1636 года хан Кока Абаков, согласно союзнического договора, выступил совместно с русскими в поход против енисейских киргизов. В своей работе «Телеуты и русские в 17-18 веках» профессор Уманский А.П. ссылаясь на И. Фишера, отмечает, что хан Кока совершил весной этого же года поход на Кузнецкий острог. Скорее, всего, это была уловка Кузнецкого воеводы Г. Кушелева, который преследовал цель: перевооружения Кузнецкого гарнизона, более современным оружием. В итоге Кузнецкий гарнизон получил на вооружение 63 ручных пищали и 50 карабинов.

С 1635 года по 1642 год теленгеты и русские все спорные вопросы между собой решали путем дипломатических отношений, не прибегая к военной силе.

Военные походы Собанского П. в 1642 году против тёлёсов, Дорофеева П. в 1643 году на керсагалов, попытка объясачивания в 1643 году Ш. Яковлевым захребетных Мундусской, Тотошской, Кузегецкой «волостей»— уделов башчи Ентугая Конаева, родного дяди хана Коки, обострили противоречия между Теленгетским ханством и Россией. В отписке кузнецкого воеводы Дементия Кафтырева томскому воеводе, стольнику, князю Семену Клубкову-Масальскому, датированной 2 апреля 1643 года, сообщается: «не платят де государеве ясаку захребетных волостей мундусские да тотошские да кезегецкие люди… к государевой милости не пошли, и под государевою царскою высокою рукою жить не похотели, и в государеве де ясаке отказали и впреть платить не хотели, и с ними де с Шестачком Яковлевым с товарыщи учали бой, из луков стрелять, и они де служилые люди Шестачко Яковлев с товарыщи с теми мундусскими и тотошскими и кесегецкими людьми, прося у бога милости, учали битца и над нами промышлять; с божией милостью и государским счастьем… мундусских и тотошских и кесегецких людей на бою многих побили и иных переранили, и з бою многие раненые разбежались, а жен и их детей в полон поимели… а их де, господине непослушников было 35 человек» .

В своих работах «Горный Алтай в 17— середине 19 в.: проблемы политической истории и присоединения к России», «Присоединение Алтая к России» Г.П. Самаев, не правомерно относит сеок Мундус к туу теленгетам (алтай-теленгетам). Аналогичную ошибку допускает профессор Уманский А.П. в своей работе «Телеуты и их соседи в 17— первой четверти 18 века». Сеок Мундус это ак-теленгетский сеок. В Русской Исторической Библиотеке о сеоке Мундус проживающих на правобережье реки Катуни, современной территории Майминского и Чемальского районов Республики Алтай сообщается: «Тут мы находим Мундусскую волость, жители которой причислялись к „белым калмыкам“, т.е. к телеутам» .

Обострение отношений с Россией вынудило хана Коку Абакова в 1645 году установить добрососедские отношения с Джунгарским Улусом.

12 июня 1646 года в связи со смертью Российского царя Михаила Федоровича и воцарением Алексея Михайловича в 1645 году, в Ургу хана Коки прибыло русское посольство во главе с П. Собанским. «В день приезда послов в их палатке была принята шерть (имеется ввиду подтверждение действия договора о военно-политическом союзе между Теленгетским ханством и Россией, заключенного в 1609 году) от брата Коки-Кулудая, его дяди— Ентугая Конаева, „лутчих людей“— Битеня Невтигина, Торгая Басбейкова, Читая Тереева, Чундугара Базыбекова и Бочюги Тенбикеева за весь Улус и за князя Коку, который лично не шертвовал, мотивируя свой отказ тем, что за него уже в Томске дали шерть Ентугай и Урузак» . Отказ хана Коки от личной шерти не устраивал русского царя, 29 апреля 1647 года в своей царской грамоте, он предписывал томским воеводам привести к шерти самого теленгетского хана.

В 1646 году в результате военного похода Зубова Б. на тёлёсов, взаимоотношения между Теленгетским Улусом и Россией ухудшились. Хан Кока считал тёлёсов своими кыштымами, и не мог потерпеть военных действий против его ханства. Он с протестом и с запросом посылает своего посла Ч. Битенева в Кузнецк, а затем в Томск выяснить причины военных действий. В Кузнецке сослались на распоряжение томского воеводы Щербатова. Щербатов же отрицал свою причастность к организации похода. Не удовлетворившись объяснениями Томского и Кузнецкого воевод, хан Кока прекратил торг в Томске, отказался от совместных военных действий против тайши Кулы и в конце 1646 года совершил поход на Боянскую, Тогульскую, Тюлюберскую волости и подгорных абинцев.

В своей работе «Древние тюрки», Л.Н. Гумилёв ошибочно определяет дату объединения тёлёсов с теленгетами. Он определяет её серединой 18 века: «Объединение тёлёсов с теленгетами произошло лишь в середине 18 в., когда теленгеты, бывшие подданными ойратов, бежали на Алтай из Западной Монголии от маньчжуров, которым император Цян лун повелел перебить ойратов до последнего человека» . На самом же деле, хан тёлёсов Айдар, подвергшийся неоднократным попыткам русских привести его под высокую руку российского царя, принял решение добровольно войти в состав Теленгетского ханства, не подвергая свой народ колонизации со стороны русских.

В 1648— 1649 годах была предпринята попытка, втянуть хана Коку в воеводскую распрю, но он не принял ни сторону О. Щербатова, ни И. Бунакова. В эти же годы хан Кока не только усилил сбор албана с двоеданцев, но и регламентировал свою и Российскую доли. «Заказал твой государев ясак платить по десять соболей с человека не велел, а велел платить твой государев ясак по 5 соболей с человека, а по 5 соболей велел Кока к себе приносить» .

В начале 1650 года томские воеводы получили царскую грамоту, обязывающую привести к шерти лично самого теленгетского хана Коку на прежних условиях договора о военно-политическом союзе между Теленгетским Улусом и Россией. В апреле месяце того же года в Ургу хана Коки прибывает посольство во главе с боярским сыном Петровым. В тот же день И. Петров получил аудиенцию хана Коки. После переговоров с российским послом, хан Кока лично подтвердил действие договора о военно-политическом союзе между Теленгетским Улусом и Россией. Подтверждая лично действие договора о военно-политическом союзе, хан Кока преследовал цель объединения Теленгетского ханства, изоляции сродного брата, башчи Майчыка, и усиления своего влияния на Коксежский Улус. В подтверждение даной шерти, он обещал И. Петрову прислать своих послов в Томск. Надежды на нормализацию экономических и военных отношений в связи с заключенным договором в 1650 году не оправдались.

Уже в 1651 году хан Кока посылает своих послов с протестом по выдаче 11 беглых семей, подданых Теленгетского ханства и по поводу отравления его шурина Едерека людьми чатского мурзы Бурлака Аиткулина. Российская сторона отказалась выдать хану Коке его беглых улусных людей. По поводу отравления Едерека, не приняла каких-либо мер в отношении чатского мурзы Б. Аиткулина. В том же году, нарушив границы Теленгетского ханства, вооруженный отряд под командованием казака А. Попова с целью разведки проник в верховья реки Катуни.

Все попытки хана Коки урегулировать возникшие проблемы путем переговоров и посольских отношений не дали желаемого результата. И в 1652 году с согласия башчи тёлёсов Айдара, хан Кока переселяет весь народ Телеской волости в пределы Теленгетского ханства, а также возобновляет сбор албана с кузнецких волостей и улусов, прекращает торговлю с Российскими уездами.

Через семь лет после похода Бориса Зубова против тёлёсов, русские воеводы вновь посылают свой отряд в черневую тайгу на побережье Телецкого озера: «В 1653 году сюда прибыли русские для сбора ясака с народов, кочующих в окрестностях озера, но нашли берега его совсем безлюдными. Телесы перекочевали в не известные русским места» . Тёлёсы вернулись в прежние места обитания после разгрома Джунгарского ханства Китайской империей в 1755 году. Во времена владычества джунгарских ханов тёлёсы принявшие теленгетское подданство в первой половине 17 века, были уведены вместе с основной массой мундусов на территорию современного Киргизстана в «глубь Джунгарского ханства». В 1745 году российская экспедиция, возглавляемая П. Шелегиным, обследовала территорию прилегающую к Телецкому озеру «В Чулышманской долине экспедиция встретила около трёх десятков телеутских юрт…» .

В 1653 году кузнецкий воевода Ф.Баскаков в январе и марте месяцах проводит две карательные операции против Теленгетского ханства. В последней карательной операции Баскаков Ф. использует хорошо вооруженный огнестрельным оружием отряд в составе 200 казаков с атаманом П.Дорофеевым. Хан Кока, узнав о погроме атаманом Дорофеевым его братьев и кыштымов, выступил с резким протестом и требованием объяснения не объявленной войны против Теленгетского ханства. Томские воеводы по протесту хана Коки в августе 1653 года проводят следствие. Материалы следствия были направлены из Томска в Москву в Сибирский приказ. Указ по итогам проведенного следствия пришел в 1654 году за подписью дьяка Третьякова. В Указе было категорически запрещено воеводам без разрешения Москвы, военных действий в отношении Теленгетского ханства не производить. Пленных теленгетов и их кыштымов возвратить Теленгетской стороне. В отношении же Баскакова Ф., не были предприняты какие-либо меры наказания. Баскаков Ф. оставался Кузнецким воеводой еще в течение двух лет.

Вторая половина пятидесятых годов 16 века сопровождалась рядом войн между Теленгетским и Джунгарским ханствами.

Русские не хотели упустить затруднительную ситуацию, которая сложилась в эти годы в Теленгетском ханстве. Противостояние хану Коке младших башчиларов по Абаковской ветви Конаевской ханской династии, и сродного брата, хана Малого Теленгетского ханства Майчыка, которые в своих выступлениях против него привлекали на свою сторону ойратских тайш. После поражения хана Коки в 1655 году от Джунгарского ханства, в Ургу прибыло Российское посольство возглавляемое Я.Поповым, чтобы вновь привести его к шерти. Склонение хана Коки к возобновлению военно-политического союза с Россией, носило в себе две основные цели:

— использование Теленгетского ханства как буферного государства;

— возобновление торгового обмена.

Миссия российского посла Попова Я. не достигла поставленной перед ней цели.

Находясь в критической ситуации, хан Кока Абаков отказался от заключения с Россией военно-политического союза. Российская сторона ни разу прежде не выполняла своих обязательств по «обережке», и на этот раз ни за что не решится на совместные военные действия против Джунгарского ханства, т.к. томские и кузнецкие воеводы имеют от царя прямой указ: не чинить с ними ни каких «задоров».

В период с 1655 по 1656 год хан Кока ведет перговоры со своим сродным братом, ханом Малого Теленгетского ханства, Майчыком и киргизскими башчиларами о совместных военных действиях против Джунгарского ханства и России. В 1656 году, в октябре месяце хан Кока не принял российское посольство возглавляемое А. Сартаковым. В начале 1657 года хан Кока принял под свою высокую руку Майчыка с его Улусом в состав Большого Теленгетского ханства. Таким образом, хан Кока благодаря последовательной и мудрой политике добился прекращения внутренних междоусобных войн и восстановления единого Теленгетского ханства. В период междоусобных войн, среди мундусских князей, русские активизировали свою колонизаторскую деятельность, внушая теленгетским кыштымам мысль о том, что Теленгетское ханство распадется на ряд мелких улусов, и потеряет свою былую мощь, не сумеет постоять за своих подданых, склоняли кыштымов к добровольному переходу в подданство Российского государства. В эти годы среди теленгетских сеоков и кыштымов, был пущен слух порочащий мундусов, о их невозможности руководить государством и своими подданными. В эти годы, когда шли внутренние распри между мундусскими князьями, русская сторона распространила среди сибирских тюрков поговорку: «Мундус jуулуп Эл болбос. Бука jуулуп мал болбос» (Когда мундусы собираются вместе-не быть государству. Когда собираются вместе быки-не быть скоту), которая до сих пор бытует среди тюрков Сибири, современных алтайцев и киргизов, напоминая о тех прошедших событиях в 17 веке.

В марте 1657 года томские воеводы направили российское посольство во главе с боярским сыном И. Петровым в Теленгетское ханство, чтобы выразить свой протест по поводу предоставления убежища башчилару Майчыку. «Основная цель посольства заключалась в том, чтобы рассорить во чтобы-то ни стало союз телеутских князей. По наказу воевод И. Петров во время послования, уповая на давнюю шерть Коки, в которой был специальный пункт: „с изменниками не ссылаться“, потребовал от Коки, чтобы тот изгнал Майчика из своих улусов» . Одновременно было послано русское посольство к башчилару Майчыку, но и этот план томских воевод потерпел неудачу.

«Не смущаясь неудачей, они еще раз попытались обратить в подданных царя и Коку и Мачика „купно“. Они направили к телеутским князьям посольство во главе с Т. Путимцем с предложением выдать в обеспечение своей верности аманатов, „а ясырь их— жонку и робят— отдадут“. Но ни Кока, ни Майчык не собирались становиться „холопами“ царя»… Таким образом, томским властям не удалось ни рассорить союз телеутских владетелей, ни обратить их (порознь и «купно») в подданных русского царя» .

Невзирая на протесты и предупреждения хана Коки, в начале 1657 года русские сооружают на территории Телегетского ханства Большой Сосновский острог. В июне месяце этого же года, хан Кока Абаков вынужден был предпринять меры по сохранению целостности и неприкосновенности территории ханства, он совершил военный поход на Томский уезд и разорил Сосновский острог. Осенью по всей границе Теленгетского ханства с Россией происходят мелкие пограничные инциденты.

Томские воеводы 11 апреля 1658 года получают царскую грамоту, датированную 2 декабрем 1657 г. с инструкцией об отношениях с Теленгетскими Улусами.

20 июня 1658 года в Ургу хана Коки прибыло российское посольство во главе с Д. Вяткиным. Прием российского посольства хан Кока осуществил на следующий день, ответы на поставленные вопросы посла он обещал дать после сражения с ойратами-джунгарами. 26 июня хан Кока решил взять с собой российское посольство на место сражения с ойратами-джунгарами. Российский посол Д. Вяткин выразил свой протест, но поехал вместе с ханом Кокой на место сражения. Теленгеты в этом сражении потерпели поражение от Джунгарского войска.

Несколько дней спустя, 14 июля 1658 года, хан Кока предложил российскому послу совместную программу действий в урегулировании взаимоотношений между Теленгетским ханством и Россией. Программа совместных действий состояла в основном из четырех основных моментов: обмен пленными, возобновление с Россией военно-политический союза, посылка послов Теленгетского ханства в Москву и по итогам поездки в Москву послов Теленгетского ханства была обещана выдача Российской стороне аманатов. Хан Кока надеялся, что его послы в Москве сумеют добиться военной помощи для борьбы с Джунгарскими ханами.

29 июля 1658 года российское посольство возвратилось в город Томск. Воеводы Томска были удовлетворены итогами миссии Д.Вяткина. У воевод появилась надежда при помощи института аманатства в последствии полностью подчинить теленгетов Российской империи. Используя критическое положение сложившееся в Теленгетском ханстве, в результате войн с Джунгарским ханством, русские в кратчайший срок снарядили новое посольство в составе 11 человек и отправили в Ургу хана Коки Абакова. 2 сентября 1658 года в Ургу прибыло российское посольство во главе с сыном боярским Д. Копыловым, с ним прибыли пленные теленгеты. В тот же день на аудиенции у хана Коки Д. Копылов сообщил о том, что все военнопленные теленгеты отпущены и прибыли вместе с ним в Ургу. Напомнил хану о его обещании дать шерть по возобновлению между Россией и Теленгетским ханством военно-политического союза, об участии теленгетских войск в совместных военных походах по объясачиванию Саянской и Точинской волостей.

После аудиенции, хан Кока, башчилары Майчык и Ентугай, лучшие люди Теленгетского ханства шертовали о возобновлении военно-политического союза между теленгетами и русскими. 7 сентября 1658 года хан Кока сформировал посольство Теленгетского ханства в Москву в составе: Келкера, Мамрача, Дайчина, Урусака и Кормышака. 30 декабря этого же года посольство Теленгетского ханства прибыло в столицу Российского государства. О прибытии посольства от хана Коки в тот же день было доложено русскому царю. Переговоры вести с послами было поручено руководителям Посольского приказа, известным российским дипломатам 17 века: А. Иванову и Е. Юрьеву. А. Иванов с 1653 года по 1667 год возглавлял Посольский приказ. Прием послов состоялся в Посольской палате Кремлевского дворца. Столь высокое, внимание оказанное, Российским царем перговорам с послами Теленгетского ханства означало, что Россия признавала Теленгетское ханство: суверенным, независимым государством. 23 февраля 1659 года послы Теленгетского ханства отправились из Москвы в обратный путь. Результаты проведенных переговоров не отвечали интересам Теленгетского ханства. Послы не добились поставленной перед ними цели — оказания военной поддержки в борьбе с Джунгарским ханством. Итогом послования в Москве явилось вынужденное заключение ханом Кокой и башчиларом Майчыком не равноправного договора о союзе между Теленгетским ханством и Россией.

В течение трех лет хан Кока неуклонно следовал условиям союзнического договора. В этот период времени бурно развивался торг между теленгетами и русскими. В отличие от действий теленгетского хана, воеводы Томского и Кузнецкого острогов, неуклонно проводили в жизнь царский указ данный им в начале 17 века. Они постоянно вмешивались во внутренние дела Теленгетского ханства. Так, в начале шестидесятых годов они посулами склонили к измене племянника хана Коки башчилара Чот-Кару, предоставили ему убежище. Требование хана Коки о выдаче изменника отклонили, наоборот оказали башчилару Чот-Каре военную помощь в походе на Теленгетское ханство. Россия была чрезвычайно заинтересована в разжигании междоусобных войн среди мундусских князей, так как они неизбежно приводили к ослаблению могущества Теленгетского ханства. Поощряли принятие русского подданства беглыми теленгетами и несения ими военной службы в Томском и Кузнецком острогах. Требования о выдаче перебежчиков российскими властями всегда отклонялись. Как и в прежние времена, русские нарушали один из основных пунктов договора о предоставлении «обережки». Ни разу, начиная с 1609 года, этот пункт договора о военно-политическом союзе Российской стороной не выполнялся. Хан Кока в сентябре 1659 года обратился к Российской стороне об оказании военной помощи для отражения военных набегов ойратского тайши Сакыла Кулина, военная помощь русскими не была оказана. В отписке Российскому монарху следует: «И мы, холопи твои, без твоего государева указу, в белые калмыки… ратных людей послать не смели… А у черных, государь, калмыков улусы великие, а посе число от них твоим государевым людям дурна никаково не было» . Как и в прежние времена не решенным вопросом оставался вопрос о сборе ясака и албана с двоеданнцев. И наконец, нарушая суверинитет Теленгетского ханства, русские промышленники и чатские татары периодически хозяйничали в промысловых угодьях в междуречье рек Берди и Таболган (Иня) в Чернолесье.

Все выше перечисленные причины привели хана Коку Абакова к разрыву союза с Россией. Отказ от союза с Россией вызвал со стороны русских ответные меры. Так, в 1663 году в район реки Мерети, где распологалась Урга хана Коки был совершен военный поход кузнецким воеводой. В 1664 году на Теленгетское ханство был организован военный поход томскими воеводами.

Чтобы отстоять независимость Теленгетского ханства, хан Кока заключает с Джунгарским ханством договор о мире и сотрудничестве. Только «поддержка князей ханом Джунгарии помешала русским воеводам объясачить Телеутскую землицу в 1662— 1663 годах по частям „миром и ратью“ .

Военные действия русских воевод вынудили хана Коку перенести Ургу с Мерети на левобережье реки Оби. Около 1670 года умер хан Кока.