1846, 17 июля (н. ст.) — родился в селе Рождественском близ города Боровичи Новгородской губернии в семье инженера-путейца Николая Ильича Миклухи и его жены Екатерины Семеновны, урожденной Беккер.
1857 — поступление в школу Святой Анны в Петербурге. Декабрь — смерть отца.
1858 — перевод во Вторую Петербургскую гимназию.
1863 — исключение из гимназии и поступление вольнослушателем в С.-Петербургский университет.
1864 — исключение из университета. Отъезд в Германию. Поступление на философский факультет Гейдельбергского университета.
1865 — поступление на медицинский факультет Лейпцигского университета.
1866 — переезд в Йену. Занятия в Йенском университете на медицинском факультете.
1866 — 1868 — путешествие на Канарские острова и в Марокко.
1869 — путешествие на берега Красного моря. Возвращение в Россию. Занятия в зоологическом музее Академии наук.
1870 — 1871 — путешествие на Новую Гвинею на корвете «Витязь».
1871, 20 сентября — 1872, 22 декабря — пребывание на Новой Гвинее, на побережье залива Астролябия.
1872-1873 — отъезд на клипере «Изумруд» с Берега Маклая. Пребывание в Батавии и Бейтензорге (Богоре).
1873 — 1874 — второе путешествие на Новую Гвинею. Двукратное посещение берега Папуаковиай.
1874-1875 — два путешествия по полуострову Малакка. Постановка вопроса о необходимости взятия папуасов Берега Маклая под покровительство России ввиду угрозы аннексии Новой Гвинеи Англией.
1876-1877 — путешествие в Западную Микронезию и Северную Меланезию. Второе посещение Берега Маклая.
1878 — 1882 — жизнь в Австралии. Вступление в члены Линнеевского общества и участие в его работе. Организация зоологической станции в Сиднее. Подготовка и издание ряда научных статей.
1879 — путешествие по островам Меланезии. Письмо верховному комиссару Западной Океании Гордону о работорговле.
1880 — 1881 — два путешествия на южный берег Новой Гвинеи.
1881 — смерть сестры Ольги.
1882-1883 — поездка из Сиднея в Россию. Поездка в Германию, Францию, Англию.
1883 — третье посещение Берега Маклая.
1884, февраль — женитьба на Маргерит Робертсон.
18 ноября — рождение сына Александра Нильса. 1884-1886 — жизнь в Сиднее.
1885, 9 января — телеграмма канцлеру Бисмарку с протестом от имени папуасов против захвата Новой Гвинеи Германией.
29 декабря — рождение сына Владимира Аллена. 1886 — поездка в Россию. Выдвижение проекта организации русской колонии на Новой Гвинее. 1887 — поездка в Австралию и переезд с семьей в Петербург. Болезнь. 1888, 14 апреля — смерть.