26 марта 2000 г. одновременно с первыми выборами Путина проходили губернаторские выборы в нескольких регионах. Режиму "управляемой демократии" и "исполнительной вертикали" под эгидой и. о. президента было всего лишь несколько месяцев, но отработка его методов уже шла полным ходом. Главной задачей центральной и местной власти было избежать второго тура на президентских выборах - что и было достигнуто, хотя для этого пришлось прибегнуть к "корректировке" результатов примерно на 3-4%. Ряд местных губернаторов заодно предприняли меры для обеспечения и своего личного электорального будущего. Наиболее грубо и нечестно это было сделано в двух субъектах Федерации - в Саратовской области и в Ханты-Мансийском автономном округе.
В Саратовской области переизбирался на новый срок губернатор Дмитрий Аяцков. За пределами области Д. Аяцков известен, главным образом, предложением легализовать публичные дома, а также высказыванием, что ему настолько нравится Билл Клинтон, что он "искренно завидует" Монике Левински.
Серьезным соперником для действующего губернатора (на тот момент - члена федерального политсовета пропутинского движения "Единство") был лидер местных коммунистов Валерий Рашкин. Кроме левого и протестного электората за В. Рашкина была готова голосовать и значительная часть сосредоточенных в административном центре области либерально настроенных избирателей, уставших от авторитаризма и административных чудачеств губернатора. Местные бизнесмены (за исключением близко стоящих к администрации) тоже мечтали избавиться от Аяцкова и даже тайком оказывали коммунистическому кандидату финансовую помощь. Победа оппозиции вызывала сомнения только благодаря тому, что в Саратовской области давно отработана система "коррекции" выборов.
Однако, не полагаясь на одну только "коррекцию", команда губернатора предпочла избавиться от опасного соперника. В последний день решением областного избиркома В. Рашкину было отказано в регистрации его кандидатом в губернаторы под предлогом "значительного числа нарушений в подписных листах". Областной суд, а за ним и Верховный суд в Москве жалобу коммунистов отклонили.
Согласно официальным данным, Аяцков победил. "Против всех кандидатов" проголосовало, согласно официальным данным, около 20%, но, на самом деле, как свидетельствуют копии протоколов избирателей, значительно больше.
В Ханты- Мансийском автономном округе тамошний губернатор Александр Филипенко (блок "Отечество -Вся Россия") также предпочел подстраховать свое избрание снятием с дистанции основного конкурента - лидера Российской партии пенсионеров (РПП) бизнесмена Сергея Атрошенко. Основной идеей предвыборной программы С. Атрошенко было привлекательное предложение ввести в регионе именные свидетельства на получение каждым местным жителем определенной доли доходов от добытых на территории округа нефти и газа, прозванные "сертификатами счастья".
18 февраля 2000 г. кандидатура С. Атрошенко была зарегистрирована, но уже 9 марта 2000 г. регистрация была отменена из-за "нарушений правил расходования средств избирательного фонда", а также подкупа избирателей (обещание "сертификатов счастья").
В отсутствие реальных конкурентов 26 марта 2000 г. победил действующий губернатор.
Поскольку параллельно А. Филипенко в Ханты-Мансийском округе и особенно Д. Аяцков в Саратовской области делали максимум возможного для победы Владимира Путина на президентских выборах уже в первом туре, Кремль и Центризбирком на их ухищрения по собственному переизбранию смотрели сквозь пальцы, если не с одобрением.