Автор монографии – один из ведущих отечественных специалистов по истории народов стран Центральной Европы и в первую очередь по чешской и словацкой истории. Уже несколько десятилетий Е.Ф. Фирсов преподает на кафедре истории южных и западных славян Исторического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова, является автором разделов по чешской и словацкой истории, историографии, а также культуре Чехии и Словакии в университетских учебниках («История южных и западных славян», начиная с 1998 г., и «Историография южных и западных славян». М., 1988; Очерк истории Словакии // Словацкая литература (от истоков до конца XIX в.). Ч. I. – М., 1997; Очерк истории Словакии. XX – нач. XXI в. // Словацкая литература. Ч. II. М., 2003), а также автором более 120 научных работ, изданных в России и за рубежом.

Научные интересы Е.Ф. Фирсова охватывают широкий круг проблем: Т.Г. Масарик и Россия; чешская и словацкая историография; сецессия в культуре придунайских народов; словаки, сербы, словенцы, хорваты, чехи в России; парламентаризм в Чехословацкой республике при Т.Г. Масарике; рефлексия Т.Г. Масарика и Республики, и др. В рамках международной ассоциации масариковедов Е.Ф. Фирсов участвовал в целом ряде международных научных конференций, посвященных Т.Г. Масарику.

Высоко оценены монография Е.Ф. Фирсова «Опыт демократии в ЧСР при Томаше Масарике» (М., 1997), статьи «Милан Растислав Штефаник в России (по оперативным материалам царской и колчаковской власти)» (Милан Растислав Штефаник: новый взгляд. Martin, Slovakia, Neografia. 2001), «Ученый-комениолог Ян Квачала в России (источники о научной деятельности из Рукописного отдела Пушкинского Дома)» (Ежегодник Рукописного отдела Пушкинского Дома на 2005–2006 гг. СПб.: Д. Буланин, 2009) и многие другие; издание труда «Т.Г. Масарик: философия – социология – политика. Избранные тексты». М., 2003. (отв. ред., автор науч. комментариев и научно-справочного аппарата, ред. перевода с чеш. языка).

Доклады, сделанные Е.Ф. Фирсовым в последние годы на международных научных конференциях в Москве, Праге и Братиславе, вышли в изданиях: «Первая мировая война в литературах и культуре западных и южных славян» (М., 2004), «Češi a Němci v pojetí a politice TG. Masaryka» (Praha, 2004), «M.R. Štefánik v zrka-dle prameňov a najnovších poznatkov historiografie» (Bratislava, 2010), «Первая мировая война. Взгляд спустя столетие» (М., 2011), «Славянский мир: в поисках идентичности» (М., 2011); «Народы Габсбургской монархии в 1914–1920 гг.: от национальных движений к созданию национальных государств». Ч. 1 (М., 2012) и др.

Научные статьи Е.Ф. Фирсова публиковались в «Россия XXI», в журнале «Меценат и мир», на веб-сайте .

Е.Ф. Фирсов – член Российской ассоциации историков Первой мировой войны, научного Общества российских богемистов при Посольстве Чешской Республики, международных научных обществ, в частности – Czechoslovak Studies Association, International Masaryk’s Association, член Международной редколлегии журнала «Anthropos» – органа междисциплинарных исследований по гуманитарным наукам (издание Люблянского университета, Словения), международный эксперт по грантам в области гуманитарных наук.