Когда германские войска перешли польскую границу в ночь на 1 сентября 1939 г., то 3 сентября Великобритания объявила войну Германии. На тот момент в Южноафриканском парламенте разразились острые дебаты, сделавшие противниками тех, кто выступал за вступление в войну на стороне Великобритании (их лидером был генерал, впоследствии маршал Ян Смэтс), и тех, кто стремился сохранить Южную Африку нейтральной (их лидером был премьер-министр Р. Герцог).

Но уже 4 сентября 1939 г. Объединенная (тогда правящая) партия отказалась принять предложение Герцога о нейтралитете во Второй мировой войне и сместила его, избрав на этот поста Яна Смэтса. Став премьер-министром, Я. Смэтс официально объявил 6 сентября, что «доминион Соединенного Королевства Южно-Африканский Союз находится в состоянии войны с Германией и другими странами “Оси”».

Одновременно были арестованы до конца 1945 г. деятели, выступавшие против участия ЮАС в войне.

Ян Смэтс был единственным из «небританских» генералов, в чьих советах нуждались Уинстон Черчилль и британский генералитет. Еще в июле 1939 г. генерал Смэтс был приглашен в Имперский объединенный военный кабинет, а 28 мая 1941 г. — он стал фельдмаршалом Британской армии и маршалом ЮАС.

Одной из главных проблем, постоянно актуальной для ЮАС в годы войны, была нехватка людей. Из-за небезызвестной расовой политики армия могла состоять только из лиц европейского происхождения, что резко сужало количество потенциально военнообязанных мужчин в возрасте от 20 до 40 лет включительно, то есть сужало этот показатель до 320 тыс. чел. Опять-таки, из-за расовой политики страны допуск в боевые части лиц, принадлежащих к негроидной расе, вообще не рассматривался. Чтобы высвободить для боевых и технических частей как можно больше белых, было сформировано много вспомогательных частей; из благонадежных индийцев и «цветных» был сформирован «Кейп-корпус». А для выполнения саперных и т. п. работ был сформирован Туземный военный корпус из чернокожих. Для выполнения некоторых задач участникам этого корпуса выдавалось оружие — в основном для самозащиты или караульной службы. Но им никогда не позволялось участвовать в боевых действиях против европейцев.

Вооруженные силы ЮАС в 1940–1941 гг. получили новейшее по тем временам вооружение из Великобритании и особенно из США. Южноафриканские войска принимали непосредственное участие в Эфиопско-Сомалийской (1940–1942 гг.). Североафриканской (1940–1943 гг.) и Итальянской (1943–1945 гг.) кампаниях Второй мировой войны. Плюс к тому, войска ЮАС участвовали весной 1942 г. в освобождении французского Мадагаскара (соседнего с ЮАР крупного острова) от сторонников прогерманского Вишистского правительства Франции. Кроме того, в южноафриканских портах, а также в портах принадлежавшей ЮАС Намибии осуществлялось обслуживание судов союзников, следовавших через Индийский и Атлантический океаны вокруг мыса Доброй Надежды, в том числе с союзническими грузами для СССР (через порты Ирана и Ирака).

Отметим в этой связи, что свыше 15 % общего объема поставок в Советский Союз грузов — в рамках ленд-лиза со стороны западных союзников для СССР — направлялось из ЮАС. Это были бронетранспортеры, грузовые автомобили, хлопок, руды некоторых цветных металлов и их сплавов. А также цитрусовые, говяжья тушенка, шерсть, кожаное сырье. Упомянутые факторы привели к установлению дипломатических отношений между ЮАС и СССР в конце февраля 1942 г.

Что касается конкретного участия этой страны в военных действиях — две пехотные дивизии ЮАС приняли участие в операциях в Египте, Ливии и Тунисе, включая сражения вблизи Суэцкого канала (при египетском Эль-Аламейне). После чего одна из этих дивизий в 1943-м была возвращена на родину и переформирована в 6-ю бронетанковую дивизию, которая участвовала в освобождении Италии, в том числе Сардинии и Сицилии. ВВС ЮАС участвовали в боевых действиях над Северо-Восточной Африкой, Северной Африкой, а также над Италией, Грецией, британской Мальтой. Они же участвовали в бомбардировках в 1943–1944 гг. румынских месторождений нефти (в Плоешти), в доставке продовольствия, медикаментов и вооружения повстанцам во время Варшавского восстания (1944 г.). Вдобавок, ВВС Южно-Африканского Союза с баз на британских Мальте и Кипре оказывали поддержку советским войскам в ходе Львовско-Сандомирской операции (1944 г.).

Отметим также, что после захвата Бельгии германскими войсками (к концу мая 1940 г.) войска ЮАС, включая его ВМФ, совместно с бельгийскими частями и флотом в 1940–1944 гг. патрулировали ряд районов Бельгийского Конго. Из 334 тыс. граждан ЮАС, участвовавших в борьбе с фашистскими агрессорами (211 тыс. «белых», 77 тыс. «черных», 46 тыс. «цветных» и «азиатов»), около 10 тыс. погибли в боях или пропали без вести. В некоторых районах Италии, в том числе Сицилии установлены памятные знаки в честь погибших воинов ЮАС (см., например: «ЮАР. Справочник». М.: Наука, 1986; «Египет, Эфиопия, Либерия, ЮАС». М.: Географгиз-Госполитиздат, 1947; «Эритрея». М.: Географгиз, 1952).