В истории отечественных спецслужб обеспечение оперативного взаимодействия и координации традиционно являлось одной из самых трудноразрешимых проблем.

Внутриведомственное взаимодействие (особенно в период деятельности КГБ) осуществлялось на базе долгосрочных планов по линиям работ, утверждаемых соответствующими приказами на уровне высшего руководства. Каких-либо нормативных актов общего характера, регулирующих оперативное взаимодействие, кроме общего внутриведомственного Положения о КГБ, не существовало.

Наиболее серьезными факторами, влияющими на успешное взаимодействие, всегда являлись межличностные отношения руководителей субъектов разведывательной и контрразведывательной деятельности как между собой, так и с руководством соответствующих подразделений МВД, а также неискоренимый принцип «кто первый доложит, тот и формирует наградные листы».

Сегодня, когда в результате разграничения ряда оперативно-розыскных функций произошел вполне определенный разрыв между ее отдельными видами и участниками процесса обеспечения общенациональной безопасности (за эффективность функционирования различных звеньев системы национальной безопасности России теперь отвечает около десяти государственных ведомств и учреждений), проблема взаимодействия и координации их деятельности становится особенно актуальной.

По мнению ряда специалистов, отсутствие в стране такой концепции обеспечения национальной безопасности, которая четко определяла бы место и роль каждой спецслужбы, значительно затрудняет разработку практических программ взаимодействия субъектов защиты интересов национальной безопасности.

Вполне естественно, что при отсутствии единых, скоординированных программ взаимодействия различных спецслужб, которые возможно реализовать, например, ежегодными директивами президента страны, существенно снижается качество работы каждой из них. Это сказывается на конечном совокупном результате работы, неизбежно приводит к определенным «нестыковкам», а в ряде случаев и к вмешательству одной спецслужбы в компетенцию другой.

В результате имеющиеся в организации координации и взаимодействия недостатки неизбежно приводят к тому, что каждая спецслужба, имея представление лишь о собственной роли, нередко действует не как часть единого взаимосвязанного комплексного механизма обеспечения соответствующей безопасности, а автономно.