Web-сайты, имеющие отношение к хроматину и эпигенетике
Chromatin Structure and Function ? Страница ресурсов по хроматину Джима Боуна http://www.chromatin.us
Epigenome Network of Excellence ? Web-сайт Европейской междисциплинарной сети исследований по эпигенетике http://www.epigenome-noe.net
HEP ? Исследовательский консорциум по проекту «Эпигеном человека» http://www.epigenome.org/
ENCODE ? Энциклопедия элементов ДНК: идентификация функциональных элементов у человека http://www.genome.gov/12513456
ChromDB ? База данных по хроматину растений http://www.chromdb.org/
Ресурсы по гистонам
The NHGRI histone database ? Содержит информацию по последовательностям гистонов http://research.nhgn.nih.gov/histones/
Abeam histone page ? Содержит загрузки карт модификаций гистонов http://www.abcam.com/chromatin
Histone.com page (Upstate) ? Карта модификаций гистонов, созданная Upstate http://www.histone.com/modification_map.htm
Белки хроматина
NPD-Nuclear Protein Database ? Коллекция известных белков позвоночных, локализованных в ядре http://npd.hgu.mrc.ас.uk/index.html
Chromatin proteins ? Линк с исследованиями on the NPD site ограниченными семействами белков хроматина http://www.epigenome-noe.net/researchtools/structure.php
Flybase chromatin page ? Покрывает Polycomb, trithorax и другие белки хроматина у Drosophila http://flybase.bio.indiana.edw'allied-data/lkinteractive-fly/aignfam/polycomb.htm
Метилирование ДНК
MethDB ? База данных по метилированию ДНК человека http://www.methdb.de/
DNA methylation society ? Web-сайт, посвященный аспектам биологического метилирования http://www.dnamethsoc.com/
CpG island searcher ? Алгоритм поиска последовательности островков CpG http://www.uscnorris.com / cpgislands2/cpg.aspx
Импринтинг
Mouse genomic imprinting ? Хромосомные карты мыши, показывающие известные импринтированные районы http://www.mgu.har.mrc.ас.ик/research/imprinting/
Gene Imprint ? Информационные ресурсы WWW по геномному импринтингу http://www.geneimprint.com/index.html
Impnnted Gene Catalogue ? База данных по импринтированным генам http://igc.otago.ac.nz/home.html
Candidate imprinted transcripts ? Ресурс предсказанного импринтированного транскриптома человека и мыши http://fantom2.gsc.riken.go.jp/imprinting/ (продолжение на следующей странице)
RNA
NONCODE ? База данных, посвященных некодирующим РНК http://www.bioinfo.org.cn/NONCODE
RNAdb ? База данных по некодирующим РНК млекопитающих http://research.imb.uq.edu.au/madb
Micro RNAdb ? База данных по микроРНК эукариот http://166.111.30.65/micromadb/
miRBase ? Ресурс данных по микроРНК http://microma.sanger.ас.uk/
NARNA ? Платформа для поиска природных антисмысловых транскриптов http://www.nama.ncl.ас.uk/
ASRP ? Ресурс данных по малым siPHK и miPHK Arabidopsis thaliana http://asrp.cgrb.oregonstate.edu/
Коммерческие сайты ресурсов по эпигенетике
Abeam ? Поставщики антител к гистонам http://www.abeam.сот/
Upstate ? Поставщики антител к гистонам http://www.upstatebiotech.сот/
Epigenomics ? Диагностический скрининг метилирования ДНК http://www.epigenomics.com/
Ресурсы и базы данных по геномам организмов
Все эукариоты
NCBI ? Портал к сайтам по множественному геномному анализу и ссылкам http://www.ncbi.nlm.nih.gov
ENSEMBL ? Браузер по эукариотическим геномам http://www.ensembl.org
UCSC Genome Bioinformatics ? Портал геномных последовательностей и ресурсов http://genome.ucsc.edu
EBI ? Портал к различным ресурсам по компьютерному анализу генома и протеома http://www.ebi.ac.uk/services
Sanger Institute ? Портал к ресурсам по последовательностям, биоинформатике и протеомике http://www.sanger.ac.uk/
BCM Search Launcher ? Портал для поиска последовательностей и средств анализа http://searchlauncher.bcm.tmc.edu/docs/sl_links.html
zPicture ? Средства сравнительного анализа последовательностей http://zpicture.dcode.org
iHOP ? Информация с гиперссылками по ресурсам белок — белок http://www.ihop-net.org/UniPub/iHOP/
Repeat Masker ? Алгоритм повторящихся последовательностей для идентификации повторяющихся последовательностей ДНК http://repeatmasker.org
Primer 3 ? Базирующаяся на Web программа конструирования праймеров http://frodo.wi.mit.edu/cgi-bin/primer3/primer3.cgi
Отдельные организмы
S. cerevisiae
— SGD — база данных по геному Saccharomyces http://www.yeastgenome.org
— ENSEMBL ? портал анализа генома S. cerevisiae http://www.ensembl.org/Saccharomyces_cerevisiae/index.html
S. pombe
— Портал к сайтам по геномным последовательностям, родственным S. pombe, и по их анализу http://www.sanger.ac.uk/Projects/S_pombe/
T. thermophda
— TGD — база данных по геному Tetrahymena http://www.ciliate.org/
— Проект по секвенированию макронуклеарного генома Tetrahymena http://www.genome.gov/12512294
A. thaliana
— TAIR — ресурс информации по Arabidopsis GRAMENE — сравнительная геномика трав http://www.arabidopsis.org http://www.gramene.org/
— Ресурс по геному риса http://www.tigr.org/tdb/e2kl/osa1/
C. elegans
— Портал к ресурсам по C. elegans http://www.wormbase.org/
— ENSEMBL — портал по анализу генома C. elegans http://www.ensembl.org/Caenorhabditis_elegans/index.html
— Портал к сайтам по геномным последовательностям, родственным С elegans, и их анализу http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/
Drosophila
— База данных по геномуDrosophila http://www.flybase.net
— ENSEMBL-портал геномного анализа!), melanogaster http://www.ensembl.org/Drosophila_
X. laevis
— Информационная база данных http://www.xenbase.org/
Мышь
— Информатика генома мыши http://www.informatics.jax.org
— Ресурс по штаммам мышей http://jaxmice.jax.org/index.html
— Проект Бейлора по геному мыши http://www.mouse-genome. bcm.tmc.edu/
— ENSEMBL — pecypc по мыши http://www.ensembl.org/Mus_musculus/index html
Человек
— Портал ресурсов по геному человека http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide_human/
— ENSEMBL — портал ресурсов по геному человека http://www.ensembl.org/Homosapiens/index.html
— GDB — база данных по геному человека http://www.gdb.org