4-Фенилбутират (РВА), 460
5-Аза-2’-дезоксицитидин, 459-460
5-Азацитидин, 459-460
Abfl, 76, 81
Absent Small или Homeiotic (ASH)
— семейство, 179, 223, 232, 235-236, 240-242
ACF, компенсация дозы и, 309
Ade2 как репортерный ген у дрожжей, 72-73
Adeb, 109-110 Air ген, 358, 360-361,363
Alcohol dehydrogenase (Adh) трансгены, 99
am гены, RIP и 120
ANT. См. Измененная Ядерная Пересадка (ANT); комплекс Аntennapedia (ANT-С)
Antennapedia (ANT-С) комплекс, 231
Arabidopsis
— Arabidopsis RNAiy, 156-157, 162-165
— веб-сайты с информацией о, 466
— как модельный организм, 35-37
— клеточная пролиферация и, 224
— компоненты эпигенетической регуляции у, 171-177
— организация генома, 54
— формирование гетерохроматина, 101-102
Argonaute белки, 121, 145, 149, 154-156, 162-164, 282, 295, 377
Argonaute-подобные белки, 121, 123, 145, 149,155-156, 163-164, 282,295
Arp. См. Белок 4, родственный актину ASH семейство. См. Absent Small или Homeotic Asm-1, 122-123,282
ATRX ген, 434 Aubergine, 100
BCR, 393, 397
Bithorax комплекс (BX-C), 231
Blimp1, 372-374, 398-400
Bmi1, 223-225
Brahma, 49, 233, 243
BRG1, 235-236
BRM. См. Brahma Brown доминантный (bwD), 98
В-клетки, 388-392, 398-401
c-Kit рецептор (CD117) 390
C. elegans
— MES-модификаторы гистонов у, 296-298
— MSUD у, 296
— PcG-гены у, 215
— PRC2 и, 214-215
— RNAi и, 164
— X -хромосомная регуляция у 292, 294-298
— анатомия, 289
— веб-сайты с информацией о, 467
— гетерохроматиновые метки на единственной Х-хромосоме, 294-295
— детерминация пола у, 287-288 з
— ародышевых клеток спецификация у, 294, 373-374
— импринтинг Х-хромосомы сперматозоида у, 298-299
— компенсации дозы комплекс у, 288, 290-293
— неклеточно-автономный сайленсинг и транзитивность, у 184
— оценка отношения Х:А у, 290-291
— половых хромосом дисбаланс у, 288
— сайленсинг у, 283
— центромеры структура и функция у, 271
CAF. См. Фактора Сборки Хроматина комплекс
CARM 1, 201
Cd79a, клетки 391
CDKN1C, Беквита-Видеманна синдром и, 428, 430-431
Cdx2, 379
CenH-район. См. CENP-A
CENP-A
— RNAi и, 157
— общий обзор, 247-248
— поддержание, 114
— сайленсинг и, 115
— центромерный хроматин, 252-253, 272-275
— цетромеры дробянковых дрожжей и, 113-116
— эволюция центромеры и, 276-277
CHD белки, 197, 239 Chfr, 454
Chp1,109-110, 112, 114, 156,158-161
Chp2, 109-110
CHRAC, 309
Chromoshadow-домены, 93, 199, 305
Cidl2, 112, 114, 159-160
cis-модификаций паттерны
— H2AZ и, 258
— MSL комплекс и, 308
— болезни и, 426, 435-437
— геномный импринтинг и, 353-355, 363-364
— посттрансляционная модификация гистонов и, 204
CKcnplot1, 360
CLF. См. Курчавый лист
Clr4
— siRNA продукция и, 113
— гетерохроматина формирование, 110-114, 156-162
— рекрутирование энзимов, модифицирующих хроматин, 161-162
CMT3, 178
CpG динуклеотиды
— CpG-островки, раковые заболевания, 448-449, 451-452, 456-457
— МеСР2 и, 342-343, 432-433
— веб-сайты с информацией о, 465
— геномный импринтинг и, 362
— гиперметилирование, 449
— метилирование ДНК и, 51, 326, 334-338, 361,425
— модификации гистонов и, 455
— раковые заболевания и, 447
— у растений, 169
CPSF-A. См. Фактор-А специфичности расщепления-полиаденилирования
CREBBP, 432
CTCF, 340-341, 362-363
Cul4, 160
D. Melanogaster, спецификация зародышевых клеток у 373-374
D1, 101
d48, клеточная линия, 141-142, 147
DDM1. См. Сниженное метилирование ДНК 1
DDP1, 101
Demeter (DME), 174, 178, 181, 188, 378
Dicer
— MSUD и, 123
— RNAi-опосредованный сайленсинг у растений и, 182-187
— scnRNA модель и, 147
— siRNAsH, 112, 158-161
— модификации гетерохроматина и, 161-162
— подавление и, 121
— сперматогенез и, 377
Dicer-подобные (DCL) белки, 182-183
DIM-2, 120-123
DIM-5, 121-122
Dlk1 кластер, 357-359
DMRs, 357-359
Dnmts. См. Метилтрансферазы ДНК (DNMTs)
Docking-домены, 258
DOT1, 198,267, 297
DPY белки 290
dRingl (dRingl/SCE) белки, 219-220
DRM. См. Метилтрансферазы с перестроенными доменами Drosha, 185
Drosophila
— kismet (kis) и, 239-240
— MSUD отсутствие у, 283
— PcG гены у, 55, 216, 218, 220
— polyhomeotic (ph) дупликация у, 220
— PRC1 «нацеливание» у, 220-222
— RNAi и, 164
— веб-сайты с информацией о, 467
— гетерохроматину, 93, 100-101, 278-279
— дисфункция половой хромосомы у, 283
— как модельный организм, 36-37
— кариотип, 303 клеточная память и, 211
— компенсация дозы у, 288, 302-311
— метилирование и, 51
— модификации гистонов, сайленсинг и, 95-96
— мозаичные фенотипы у, 88-90
— «нацеливание» формирования гетерохроматина, 97-100
— неоцентромеры у, 272
— организация генома, 55
— процесс сегрегации у, 279
— сайленсинг и, 95-96, 101-102
— утрата отцовской хромосомы у, 281
— фактор нарушения сегрегации, 280-281
— хромосомные белки и модификаторы у, 90-93, 96-97, 268
— центромерный хроматин и, 274
dsRNA. См. Двухнитевая РНК
dsx гены, 306-307 DTip60, 259
E(var) (Enhancer of variegation), 90-92
E(Z) семейство. См. Энхансера zeste (E(Z)) семейство
E(Z)-ESC комплекс, 296-297. См. также PRC2
Е2А, 391-392
ЕЗ убиквитинлигаза, 429, 454
EBF1, 390-392
EMF. См. Эмбриональный Цветок (EMF)
ENCODE, 465
Enx1, 223, 325
ERC, 84
ESC. См. Сверхчисленные половые гребешки (ESC)
Eversporting displacements (Хромосомные перестройки, обусловливающие мозаичное проявление признака), 14, 27. См. также Мозаицизм, обусловленный эффектом положения
EZH2, 200, 224, 325, 388, 394
Ezh2/Enxl. 325
FACT. См. Облегчение транскрипции хроматина
Female-sterile homeotic (fsh) ген, 232
Flamenco, 164
Flt3, 390
FMRP белок, 436-437
FOX-1, 290
FR901, 228 460
Fragilis, 373
FWA., 164
G9a, 400
GAGA фактор, 243
GASC1. См . jumonji-деметилаза гистонов (JHDM1)
Gnas семейство, 357-359, 428, 431
GNAT семейство, 194
Groucho семейство, 399-400
Gtl2,360
HI, 260, 472
H19 ген, 352-353, 360, 362-363, 428, 430-431
H2A
— дефектный по тельцу Бара (H2ABbd), 248, 259
— определение, 248
— откладка и замещение, 258-259
Н2АХ, 255-257, 267, 472
H2AZ 248, 257-259
— локализация, 250
— макро, 259, 323
— формирование вариантов, 248
Н2В 258-259, 469
H3, 196, 247-248, 251-254, 273-275, 469-471
H3.3, 248, 254-255, 275
H3.Зрепрограммирование сперматозоидов, 378
H3K27, метилирование
— MES белки и, 296-298
— PRC «нацеливание» и, 221
— V(D)J рекомбинация и, 394
— Х-инактивация и, 325-327
— гетерохроматиновый сайленсинг и, 95-96
— общий обзор, 200
— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 375
H3K36, 197-198, 297
H3K4, 196-197, 325-326
H3K79, 198, 267
H3K9
siRNAs и, 154 su(var) и, 95-96
— в единственных Х-хромосомах самцов C. elegans, 294-295
— метилирование ДНК и, 339-340
— «нацеливание» на гетерохроматин и, 87
— общий обзор, 198-200
— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 375
— распределение репрессированной ДНК, 138
— сайленсинг и, 95-96. 101-102, 109-111, 145-146
— сперматогенез и, 376
— у растений, 179
— центромерный хроматин и, 274
Н4
— KYP/SUVH4, 180
— MSL комплекс и, 304
— SIR комплексы и, 79-80
— общий обзор, 200
— таблица, включая ссылки, 471
— формирование вариантов и, 248
Нах гены развитие примордиальных зародышевых клеток и, 373
HBRM, 237
HDAC. См. Деацетилазы гистонов (HDACs)
HDOT1L, 198
her-1 ген, 291-293
HIC-1, 455
HIRA. См.Регулятор гистонов А
HKMTs. См. Метилтрансферазы лизинов гистонов (HKMTs)
HML, 74-75
HMR, 74-75
НО эндонуклеаза, 74-77
НОАР (HP1/ORC ассоциированный белок). 269
Homeless, 99-100 HOTHEAD ген, 21
Нох гены
— PcG белки и 212-213
— PcG сайленсинг и 219
— PREs и 220
— Sex combs reduced (Scr) и 234
— клеточная память и 211, 231
— регуляция у Drosophila 231-233
НР1. См. Белок гетерохроматина 1
HpaII крошечные фрагменты, 336-337, 340
НРone, 121
Hrr1, 112, 114, 159-160
hSET, 241
HU белки, 248
IAP ретротранспозон, 375, 377
ICE, 358-359, 361-363
ICF синдром. См. Иммунодефицитная Центромерная Нестабильность
IFNB1, 399
IGF2
— Беквита-Видеманна синдром и, 428, 430-431
— геномный импринтинг и, 352-353, 357-359, 362-363
— рак толстой кишки и, 453
IgH, 393
Ikaros-ассоциация, 398
IL-7, рецептор 390
In(l)wm4, 91. См. также white ген
INI1, раковые заболевания и, 235
INO80-C, 259
ISWI комплексы, 239, 309-310, 415. См. также Brahma семейство; SNF2H семейство
JIL1 киназа, 97-98, 102, 305
Jumonji-деметилаза гистонов (JHDM1), 47, 200
К79 метилирование, общий обзор, 198
KCNQ, 357-359, 430
killer штаммы, 133
Kismet (kis), 234-235, 239-240
KTO белок, 242
KYP/SUVH4, 180
Light, 98
Like heterochromatin protein (LHP1), 182
Linaria vulgaris, 170
LSD1 аминоксидаза, 97
LSD1. См. Лизин-специфичная деметилаза
LSH2, 340
mb-1 ген, 392
MBD белки. См. Метил-CpG-связывающиеся белки
МеСР2, 342-343, 432-434
Medea (МЕА), 178, 180-181, 215, 217, 223-224
Medea/Fertilization independent seed formation (MEA/FIS1), 180
MEIDOS, 216
Meisetz, 376
MES белки, 215, 296-298
MIP. См . miRNAs, премейотически индуцированные метилированием
Miwi-подобные белки, 377
MIX-1 белки, 290
MLE, 304-306, 308
MLH1 ген, 437, 450, 453-454
MLL, 233, 235, 241
MNa3a. См. Микрококковая нуклеаза MOF, 304-306, 308
Morpheus-молекула (MOM), 181, 187
MS-275, 460
MSCI, 318
MSP, 459
MSUD. См. Мейотический сайленсинг неспаренной ДНК
mtF гены, 143-144
MYST семейство, 194
n-1 правило, 316, 319-320
Nanog, 375, 379-380
Nasonia vitripennis, 281
ncRNA-опосредованного сайленсинга модель, 362-364
Ndj1, 269
Necdin, 429
NESP55, 431
Neurospora crassa
— MSUD y, 117, 122-124, 282-283
— RIP и, 119 120, 123-124
— жизненный цикл, 116-117
— изображения, 118, 124
— как инструмент, 107
— как модельный организм, 36-37
— метилирование у, 117-119
— общий обзор, 116-117
— подавление у, 121-122
— сайленсинг у, 282-283
NONCODE веб-сайт, 360, 466
NotchL 391
Nowal, 146 NT-ES, 418-421
NuA4/Tip60, 259
NuRD, 343
NURF, 309, 429
NVP-LAQ824, 460
Oct4, 379-380, 416
Oenothera blandina, 101
OSA, 239
P53BP1, 198
p55, 214
PADI4, 202, 378
PAF комплекс, 198
PAI2, 162
Paramecia, 36, 130-132. См. также Инфузории
Parp, 380
Pasha, 185
Pax5, 390-392, 396, 400-401
PcG белки. См. Polycomb белки
PGC-клетки, развитие примордиальных зародышевых клеток и, 372-375
Ph 1 локус, 280
PHERES 1, 216
Pickle (PKL), 181
Piwi, 100, 154-156, 160, 164
PML-лейкемия, 56
Pol IV. См. РНК-полимераза IV
Polar granule component (pgc) ген, 374
Polycomb (PcG) белки
— CpG метилирования и, 339-340
— HP1 и, 98
— Х-инактивация и 58, 325-326
— генетическая идентификация, 212-214
— геномный импринтинг и, 362
— клеточная память и, 56, 212, 230
— метилтрансферазы гистонов растений и, 180
— метки сайленсинга хроматина и, 214-219
— модификация хроматина у животных и, 164-165
— общий обзор, 54, 219
— поддержание транскрипционного сайленсинга и, 219-223
— развитие млекопитающих и, 223-226
— функция, 55-57 хроматин растений и, 180-181
— эпигенетическая регуляция у Arabidopsis и, 176
Polycomb репрессивные комплексы (PRCs)
— H3K27 метилирование и, 200
— Х-инактивация и, 57, 223
— клеточная память и, 211
— компоненты, 219-220
— компоненты и эволюционный консерватизм, 214-216
— модификация хроматина, 218
— «нацеливание» на сайленсированные гены, 220-222
— предотвращение наследуемой репрессии, 222-223
— репрессивные функции и, 222
— транскрипционная репрессия и, 231
— у растений, 180
— функция в развитии, 218-219
Polycomb элементы ответа
— GAGA фактор и, 243
— H3K27 метилирование и, 200
— антисайленсинг и, 223
— клеточная память и, 211
Polycomb-подобный (PCL) белок 215
— PRC1 «нацеливание» и, 220-222
— транскрипционная репрессия и, 232
PRC2. См. Пререпликационный комплекс 2
Prdm1, 398-399
Priming, линия, 391
PRMTs. См. Метилтрансферазы аргининов белков
PSR хромосома, 281-282
PTGS. См. Посттранскрипционный сайленсинг генов
Pws кластер, 357-359 RAG, 393, 420-421
RanGAP ген, 281
Rapl. См. Репрессор-активаторный белок I (Rapl)
RC гистоны, 250-251
RdDM. См. РНК-направляемое метилирование ДНК
rDNA, 84, 266, 278-279
rDNA кольца, 84
RDRP. См. РНК-зависимая РНК-полимераза
Replication processivity clamp (PCNA), 250
Rid ген, 120
Rikl, 160
Ring-белки, 213. 219-220, 242. 325
RIR См. Индуцируемая повторами точечная мутация
RISC. См. РНК-индуцируемый сайленсирующий комплекс
RITS. См. РНК-индуцируемый эффектор транскрипционного сайленсинга
RITS и сборка гетерохроматина и, 158-160
— сайленсинг и, 46
— сайленсинг у S. pombe и, 112, 115-116
— сайленсинг у инфузорий и, 139, 147
— сайленсинг у растений и, 182-187
— сборка «молчащего» хроматина и, 112
— сперматогенез и, 376
RNAi, 269. См. также Меиотический сайленсинг неспаренной ДНК (MSUD); Посттранскрипционный сайленсинг генов; Подавление
— Arabidopsis и, 162-164
— Chpl и, 109
— Drosophila и, 99
— dsRNA и siRNA и, 158-161
— НР1 локализация и, 121
— N. crassa и S. pombe и, 107
— ncRNAs и, 358-359
— PTGS у растений vs., 177
— геномные перестройки и, 139
— доказательства роли в сайленсинге, 156
— ломкой Х-хромосомы синдром и, 437
— метилирование ДНК млекопитающих и, 339-340
— модели распознавания и, 160-161
— модификация хроматина и, 113, 162-164
— общий обзор, 52-53, 153-154
— развитие многоклеточных и, 36
— рекрутирование хроматин-модифицирующих энзимов, 161-162
— сборка гетерохроматина и, 87-88, 102, 153-165
— структура хроматина и, 156-158
— у инфузорий, 130, 139, 147
Rolled, 93
roXRNAs, 48-49
Rsp, 281
RTT. См. Ретта синдрома
R-делеционные элементы, 143-144
Saccharomyces cerevisiae
— trans-взаимодействие у, 81-82
— trxG белки и, 236
— ацетилирование гистонов и, 80
— веб-сайты с информацией о, 466
— выпетливание теломер и, 80-81
— генетические инструменты, 72-73
— гетерохроматин, 74-78
— деацетилирование гистонов и, 78-79
— жизненный цикл, 73-74
— идентичность центромеры и, 275
— как модельный организм, 36-37
— наследование эпигенетических состояний у, 82-83
— нестабильность рДНК-повторов у, 84
— общий обзор, 71-72
— описание, 72-73
— организация генома, 54
— репрессия и, 79-80
— сайленсинг у vs. у S. pombe, 107-108
— структура и функция центромеры у, 270-271
— тайминг репликации. 266
Sad-1 (Супрессор доминирования аска) ген, 123-124, 282
SAGA, 49, 257
Sallimus (sis) ген, 242 Sas2, 80, 303-304 Sccl, 83
Schizosaccharomyces pombe
— RNAi y, 112-114
— Sir2 белок и, 75
— веб-сайты с информацией о, 466
— гетерохроматин и RNAi и, 156-158
— гетерохроматиновая организация хромосому, 156-158
— идентичность центромер и, 271
— как модельный организм, 36-37
— кинетохоры и, 271
— общий обзор, 107-108
— организация генома, 54
— сайленсинг генов и, 52
— сайленсинг хроматина у, 108
— сборка «молчащего» хроматина и, 111-113
— состав центромер, 113-115
— супрессия эпигенетического мозаицизма, 62
— транскрипция центромерных повторов у, 113
— эпигенетическая наследственность центромерного состояния у, 114-115
SCID-мыши, 420
Scmx ген, 328
scnRNA модель, 52, 147
SCNT. См. Терапевтическое клонирование
SDC белки, 288, 290
sea-1, 290
SEP-домены. См. S-аденозил-метионин (SAM)
SET-домены
— trxG белки и, 236
— модификации гистонов и, 179-180, 196,241
— развитие зародышевых клеток и, 376
— ремолелинг хроматина и, 216
— формирование плазматических клеток и, 400
Sex combs reduced (Scr), 232, 234
SEX-1,290
SFRPs, 455
SIR белки. См. Белки-регуляторы «молчащей» информации siRNAs
— dicer-подобные (DCL) белки и, 184
— RITS и, 158-160 scnRNAsvs, 145
— генерация, 158-159, 161-162
— подавление и, 121
— сборка гетерохроматина и, 159
SKD белок, 242
SLC22A1L, 430
SMARCAL1, 435
SMYD3, 197
SNF2, 49, 204, 340
snoRNAs, 360, 428-429
SNURF-SNRPN, 429
Sonic hedgehog (Shh), 225
Sox2, 379-380
Splayed (SPD), 181
SPM-домены, 14. См. также S-аденозил-метионин (SAM)
SRY ген. 315
Stella, 99, 372-375
Su(var) гены
— Drosophila и, 90-93
— H3K9 метилирование и, 95-96
— компенсация дозы и, 309
— метки сайленсинга хроматина и, 214
— репрограммирование сперматозоидов и, 378
— сперматогенез и, 376
— эффект положения мозаичного типа, 37
SubTOBv, 260
SUPERMAN, 36, 162, 186
SUVH белки, 101, 180, 199-200
SWI/ISWI энзимы. См. Brahma-семейство
SWI2/SNF2, репрессия хроматина и, 235-236, 239
Swi6, 110-112, 114, 156-161
Switch2/Sucrose Non-Fermentable2 (SWI2/SNF2)
— H2AZ и, 257, 260 МеСР2 и, 433
— метилирование ДНК и, 340
— метилирование и, 49
— модификации гетерохроматина и, 163
— ремоделинг хроматина и, 181
— структура нуклеосом и, 204
SWR1-C, 259 SXL, 306-307
S-аденозил-метионин (SAM), 179, 215, 220, 445, 448
S-фаза митоза, 83, 266-267
Т. themiophila, веб-сайты с информацией о, 466
“ТА” внутренние элиминируемые сегменты (IES), 137
ta-siPHK, 185 TCRp, 393
Tetrahymena, 36, 52, 131-132. См. также Инфузории
TGS. См. Транскрипционный сайленсинг генов (TGS)
Tip60, 259, 305
Toll-подобные рецепторы, 51
Tonalli (Тпа) ген, 2452
tra гены, 306-307
Trans-sensing, 282
trans-эффекты, 41, 191-192, 258, 426, 431-435
Trithorax (trxG) белки
— PcG белка рекрутирование и, 220
— SET-домены в, 236
— идентификация, 232-235
— как активаторы или антирепрессоры, 243
— клеточная память и, 54, 56, 211-212, 231
— метилтрансферазы гистонов и, 179
— модификации гистонов и, 242
— общий обзор, 55-57,231-236,242-244
— транскрипция и, 235-236, 243
— функциональные взаимодействия между, 242
— хроматин и, 236-242
Tsix ген, 317, 319, 321-322
Twi1 ген, 145-146, 156
U7 малый ядерный рибосомный комплекс, 250
Ube3aas, 360
Ura3, 72-73
V(D)J рекомбинация, 390, 393-394
Variable Surface antigen Genes (VSG). 16
VRN-комплекс, 180, 214-219
white ген, 71, 88-89, 98-99
Winged helix домены, 000
wm4, См. white ген
Wnt путь, 455
Х-инактивации центр (XIC), 57, 317, 325, 327
Х-инактивация, 57, 223, 314, 317-322
— H2A варианты и, 259-260
— PcG репрессия и, 224
— болезни и, 434
— воспроизведение и поддержание у млекопитающих, 317-322
— идентификация у млекопитающих, 316
— импринтированная, 317-319, 321-322
— инициация у млекопитающих. 317-322
— исторические симпозиумы и, 16
— клонирование и, 417
— общий обзор, 28, 57-58, 314, 317
— определение, 287-288
— переключаемые режимы у млекопитающих, 322
— поддержание, 371
— реактивация и репрограммирование и, 328-330, 337, 375, 380
— регуляция у млекопитающих, 318-322
— случайная vs. импринтированная, 317-322
— у C. elegans, 294-299
— факультативный гетерохроматин и 57-58
Х:А отношение 290-291, 306-307
Х-реактивация, 328-330
Х-сигнальные элементы (XSEs), 290-291, 299
Х-элементы. 81 ХВР1, 399
Хее, 321
Xenopus, веб-сайты с информацией о, 478. См. также Амфибии
Xist ген
— геномный импринтинг и, 364
— исторические симпозиумы и, 16
— плюрипотентные эмбриональные стволовые клетки и, 380
— регуляция у млекопитающих, 322-323
— эмбриональные стволовые клетки и, 319
ХО эмбрионы, 320
XOL-1, 288, 290-291
Хр импринты, 298-299, 316
Yellow ген. 91 YKu, 76, 78, 80
Y-хромосомы, 90, 315
Y’-элементы, 81
—-— район, 119
А
Автогамия, 131-133, 141-143
Автономно Реплицирующиеся Последовательности (ARS), 266
Автономный путь, 216
Адаптивная эволюция, 253
Адренолейкодистрофия, сцепленная с Х-хромосомой, 425
Активный хроматин, 46, 135-136, 254-255
Аллельное исключение, 396-398
Альтернативные перестройки, 141
Амфибии, 406, 409-410, 414-416
Ангельмана синдром, 427-430
Ангиогенез, 446
Анеуплоидия, определение, 264
Аномалии, клонирование животных и, 410-411
Аномальная хромосома 10 (Ab10), 282
Антигенная специфичность, 387
Антирепрессоры, 243
Антисайленсинг, 222-223
Антисмысловая транскрипция, 340, 395
Антител разнообразие
— гены рецепторов антигенов, 389-390
— метилирование и, 51
— развитие лимфоцитов и, 392-398
— рекомбинация и, 389-390, 392-395
— соматические клетки и, 28
— эпигенетика и, 30
Апоптоз, 267, 446
Аскоспоры, 116
АТФ-hook белок D1, 101
АТФ-зависимые комплексы ремоделинга, 42, 49, 233, 237-240, 309
Аутизм, 432
Аутосомные гены, 290-293, 306-307
Аутосомные сигнальные элементы (ASEs), оценка отношения Х:А и, 290-293
Ахиазматическая сегрегация, 278-279
Ацетилирование PRC2 и, 218
— trxG белки и, 240-241
— V(D)J рекомбинация, 394
— активный хроматин и, 46
— варианты гистонов и, 135-136
— гистоны и, 28, 40
— ломкой Х-хромосомы синдром и, 436-437
— распространение комплекса SIR и, 80
— регулирование транскрипции [этой модификацией], 192-193
— репарация ДНК и, 267
— репрограммирование сперматозоидов и, 378
— транскрипциям 193-195
Ацетилтрансферазы гистонов (HATs)
— компенсация дозы и, 304
— модификации гистонов и, 46
— очистка, 36
— Рубинштейна-Тайби синдром и, 432
— у инфузорий, 135-136
— экспрессия генов и, 28-29, 80, 194
Б
База данных по хроматину растений, 172-175
Барра тельца
— Н2А и, 248,259
— Х-инактивация и, 57, 314, 316
Беквита-Видеманна синдром, 440-442
Белки Группы Высокой Подвижности (HMG), 259
Белок 1 гетерохроматина (НР1)
— H2AZ и, 258
— H3K9 метилирование и, 198-200 PcG и, 55 RNAi и, 121
— su(var) и, 37, 91-93, 101, 199, 309, 378
— сайленсинг и, 181-182, 222
— функция, 96
Белок 4,
— родственный актину (Агр4), 259
Бидл и Тэйтум (Beadle, Tatum), 116
Бисульфитная модификация, 338
Бластоцисты, ES- и TC-cells, 380
Близнецы, изменчивость у, 35
Блокирующего фактора модель, Х-инактивация и, 320
Болезни. См. также конкретные болезни
— внешняя среда и, 438-439
— геномный импринтинг и, 357, 427-439
— исследования болезней человека, 426-427
— клонирование и, 410-411
— метилирование и, 51, 344
— общий обзор роли эпигенетики в, 426-427
— структура хроматина в cis-конфигурации и, 435-437
— структура хроматина в trans-конфигурации и, 431-435
Большая бороздка, 340
Бромодомены, 42, 195, 239
В
Важное значение эпигенетики, 34
Важный (I) сайленсер, 77-78
Вальпроевая кислота, 459
Варианты гистонов. См. также конкретные варианты
— CENP-Аи, 275
Х-инактивация и, 317, 323-325
— геномный импринтинг и, 354
— общий обзор, 49-50, 247-248
— определение, 34
— репрограммирование сперматозоидов и, 377-378
— роли для, 135
— транскрипционные состояния, 204
— центромеры и, 252-254
— энзимы для, 18, 21, 48, 158
Веб-сайты, 358, 360, 465-467
Видаза [ингибитор метилирования ДНК], 459
Видообразование, MSUDh, 122-123
Вилки, репликация ДНК и, 266
Вироиды, 186
Внутренние элиминируемые сегменты segments siRNAsH, 145
— ингибирование элиминации, 143-144
— материнская наследственность и, 143
— перестройки у инфузорий, 136
— распределение гетерохроматина и, 136-137
— транскрипция и, 52
— элиминация чужеродных последовательностей, 142-143
Внутренняя клеточная масса (ICM), 318, 371-372, 379-380
Выбор, случайная Х-инактивация и, 319-321
Выпетливание, теломера, 80-81
Г
Гаметические импринты, 353, 357-359
Гаметогенез, 376-377, 416
Геликазы, 100, 112, 121, 159, 164, 237, 304-305, 308
Гематопоэтическая система. См. Лимфоциты
Гематопоэтические стволовые клетки (HSC), 225
Гемиметилированная ДНК, 51
Ген А, 140-141,437
Генетика, эпигенетика vs., 27, 34-35
Геномный импринтинг
— ncRNAs и, 359-360
— PRC2 и, 223
— Х-хромосомы сперматозоида у С elegans, 298-299
— Ангельмана синдром и, 427-430
— Беквита-Видеманна синдром и, 428,430-431
— болезни и, 426
— веб-сайты с информацией о, 465
— исторические симпозиумы и, 18
— исторический обзор 16, 350-353
— как cis-действующая регуляторная система, 353-355, 363
— как модель эпигенетической регуляции у млекопитающих, 364-365
— как моноаллельный сайленсинг, 58
— компоненты у растений, 181
— метилирование ДНК и, 354, 360-362
— определение, 349, 369
— Прадера-Вилли синдром и, 427-430
— псевдогипопаратиреоидизм и, 428, 431
— Сильвера-Рассела синдром и, 428, 431
— утрата, 60-61, 452
— функция гена и, 356
— функция у млекопитающих, 355-357
— элементы контроля импринтов и, 357-359
— эмбрионального и неонатального роста контроль, 355
Гены рецепторов антигенов, 389-390, 392-395
Гены-супрессоры опухоли, 446-447
Гептобластома, 430
Гермафродиты, 131, 213, 287-299
Гетерогаметный пол, определение, 315
Гетерозиготность, утрата, 452
Гетерокариотическая фаза, 116, 122
Гетероталличные штаммы дрожжей, 74
Гетерохроматин. См. также «Молчащий» хроматин
— H2AZ и, 257-258
— H3K9 метилирование и, 87
— RITS и RNAi и, 158-160
— RNAi и, 52-53, 153-165
— Х-инактивация и, 319, 322-325
— белки, ассоциированные с, 93-94
— в неоцентромерах человека, 252
— изменчивость у, 100-101
— исторические симпозиумы и, 17
— конститутивный, 40. 44. 57-58, 323-325
— мейотический дрейф и, 280-282
— метилирование и, 51
— «нацеливание», 99-100
— определение, 34, 40, 71
— перестройки генома и, 139-140
— перинуклеарное прикрепление, 81-82
— репрессия активности генов и, 75-77
— сборка, 77-78
— сегрегация хромосом и, 113
— спаривание и, 277-280
— типы спаривания дрожжей и, 75-77
— упаковка, 88-89
— факультативный, 40, 57-58, 323-325, 327
— центромеры дрожжей и, 109-111
— эухроматин vs., 44-46, 97, 100, 177
Гиббереллины, 216
Гипергомоцистеинемия, 435, 438
Гиперметилирование, 61, 254, 449-452
Гипермутация, 51
Гипометилирование, 60, 435, 449
Гипопаратиреоидизм, 431
Гипотеза гистонового кода
— trxG белки и, 242
— ассоциированные с гетерохроматином белки и, 254
— вариации в, 101-102
— общий обзор, 19-20, 46-47, 205, 425
разнообразие рецепторов антигенов и, 394
Гистоны
— CENP-A и, 272-274
— RAG2 и, 392, 395
— ацетилирование и, 28
— варианты у инфузории, 135
— веб-сайты с информацией о, 465
— исторические симпозиумы и, 17
— линкер, 260, 376 метилирование, 19-20
— обзор модификаций, 46-48
— общий обзор, 191-192
— поддерживающее метилирование и, 120-121
— разнообразие у, 247-248 структура, 49-50
— функция, 248
— хромосомная организация и, 34
— эволюция, 259-260
Гликозилазы, 178-179, 181, 188, 341, 343, 378
Голокинетические хромосомы, 252
Голоцентрические хромосомы,265, 277
Гомеологичное спаривание, 280
Гомеотические гены, 233. См. также Trithorax (trxG) белки
Гомеотические трансформации, 212-213
Гомогаметичный пол, определение, 315
Гомологичная рекомбинация, 72, 355
Гомология, 139-141, 143-144
Гомоталлические штаммы дрожжей, 74
Граничные элементы, 17, 19. 80-81
Д
Дарвиновская теория эволюции, 25
Двухнитевая РНК (dsRNA). См. также RNAi
RNAi-опосредованный сайленсинг у растений и, 182-187
— геномный импринтинг и, 363
— образование разрывов. 267
— сайленсинг у инфузорий, 139
— синтез, 159-160
Деацетилазы гистонов (HDACs)
— МеСР2 и, 432-433
— NuRD и, 343 PRC2 и, 215
— Sir2 семейство, 75-76, 79-80
— ингибиторы, 459-460
— исторические симпозиумы и, 19
— лейкемии и, 447
— модификации гистонов и, 46
— раковые заболевания и, 61, 345, 456-458
Дупликация, 120, 123-124, 220. См. также Точечная мутация, индуцированная повторами
З
Зависимый от гомологии сайленсинг 139
Задних Половых Гребешков (PSC) белки, 215, 219-220
Запрограммированная элиминация ДНК, 36
Зародышевые клетки. См. также Примордиальные зародышевые клетки
— Х-реактивация у, 329
— механизмы, регулирующие спецификацию, 372-377
— наследование перестроек ресничек и, 140-144
— плюрипотентность и, 379-381
— развитие, 369-374
— тотипотентность и, 54
Защитные механизмы, 50, 146-148
Зебуларин, 459-460
Зигзаг-модели организации хроматина, 43
Зиготы, 370
И
Избыточность, элементы сайленсера и, 78
Измененная Ядерная Пересадка (ANT), 421
Имагинальные диски, 212
Иммуноглобулины, 388, 395-398
Иммунодефицитная Центромерная Нестабильность (ICF), 336, 432, 434-435
Иммуноотторжение, 420
Иммунопреципитация, 22, 79-80. 95, 138,145, 193
Импринтинг. См. Геномный импринтинг Импринтинг хромосомный. См.
Импринтинг геномный Импринтированная Х-инактивация, 317-319, 321-322
Инвазивные элементы, 53
Ингибиторы, 60-61, 459-461
Индуцированная повторами точечная мутация (RIP)
— MSUD и, 122-123 RNAi и, 156
— исторические симпозиумы и, 16
— как модель, 36
— метилирование и, 50
— у Neurospora crassa, 117, 119-120, 123-124
Индуцированный антигеном рецептора сигналинг, 398
Индуцированный вирусом сайленсинг генов (VIGS), 177, 183
Индуцированный повторами сайленсинг генов (RIGS), 101
Индуцируемая активацией дезаминаза (AID), 51, 388, 398
Инсулятора модель, 362-363
Инфузории
— RNAi у. 145, 147
— активный vs. «молчащий» хроматин у, 135-136
— жизненный цикл, 132
— зависимый от гомологии сайленсинг у, 139
— как модельный организм, 27, 36
— коньюгация и, 131-132
— общий обзор, 130
— патгернинг кортикальный у 133-134
— перестройки у, 138-139
— поддержание двух геномов, 131
— системы защиты генома у, 146-148
— цитоплазматическая наследственность у, 27, 132-133, 142-143
История эпигенетических исследований
— генетика и развитие и, 27
— геномный импринтинг и, 350-353
— гиперметилирование и, 449-450
— ДНК соматических клеток и, 28
— Колд Спринг Харбор и, 14-19
— метилирование и, 28, 448-450
— механистическая
— взаимосвязанность и, 30-31
— общий обзор, 26
— трансплантация ядер и, 406
— хроматин и, 28-30
К
Канцерогены, метилирование цитозина и, 449
Кариогамия, 107, 116-118, 120, 131-132
Кариотип Drosophila, 303
Киназы
— JIL1 киназа, 97-98, 102, 305
— модификации гистонов, 47
— фосфоинозитол 3-киназа-подобных киназ семейство, 255
Кинетохоры
— CenH3 и, 252-253
— CENP-Аи, 273-275
— идентичность центромер и, 275
— сайленсинг и, 108-111, 113-114
— формирование и функция, 271-272
— функция, 269
— хромосомная наследственность и, 264
— центромеры дробянковых дрожжей и, 108-109
Клетки крови, PcG-репрессия и, 223
Клеточная память
— Нох-гены и, 211, 231
— PcG и trxG и, 55-57
— метилирование ДНК и, 334-335, 343
— общий обзор, 211-212, 230-232
— повторяющиеся элементы и, 54
— трансплантация ядер и, 417-418
Клеточные судьбы. См. Соматическое репрограммирование
Клеточный цикл, 49, 82, 221, 412
Клонирование. См. Трансплантация ядер; Репродуктивное клонирование
Клоны, 35, 409, 414 417
Кнудсона (Knudson) двухударная теория, 60
Ковалентная модификация. 34, 241-242, 244
Когезины, 83, 114-115, 165, 256-257
Коллохоры, 278-279
Кольца повторов экстрахромосомной рДНК (ERC), 84
Коммитирование линий, 390-392
Компактизация, эволюция гистонов и, 259-260
Компартментализация у инфузорий. 130
Компенсация, 419. См. также
Компенсация дозы
Компенсация дозы
— клонирование и, 417
— механизмы 58
— определение 287
— у C. elegans 288, 290-293
— у Drosophila 302-311
— у млекопитающих 288, 313-330
Комплекс компенсации дозы (DCC), 288, 290-293
Конденсация, 33, 76-77, 294, 298-300
Конденсины, их сходство с DCC, 288, 290
Конститутивный гетерохроматин, 40, 44, 57-58, 323-325
Контролирующие элементы, 14
Контрольная Точка Сборки Веретена (SAC), 269
Коньюгация, 131-132
Координация, ремоделин хроматина и, 49
Корепрессоры, 342
Короткие интерферирующие РНК (siRNA), 52, 112-114, 139
Кортикальный паттернинг, 133-134
Косупрессия, 121, 177. Си. также Посттранскриппионный сайленсинг генов
Кошки, клонирование, 35
Крючки аскогенных гиф,
Кукуруза, 280, 282
Курчавый лист (CLF), 180, 213, 215-216
Кэпирование, 80
Л
Лейкемия, 56, 235, 413, 447-448, 459
Лизин-специфичная деметилаза (LSD1), 47, 180, 200
Лизины. См. также Метилтрансферазы лизинов гистонов (HKMTs)
— ацетилирование, 194
— деметилирование, 200
— метилирование, 47, 180, 200
Лимфомагенез, 223
Лимфоциты
— ICF синдром и, 434
— В-клеток дифференцировка и, 398-401
— клонирование мышей из, 412-413
— коммитирование линий в, 390-392
— плюрипотентность и, 390
— разнообразие рецепторов антигенов и, 392-398
Линкерные гистоны, 251, 260, 376
Локализация, экспрессия генов и, 20
Ломкой Х-хромосомы синдром, 426, 436-437
М
МакКлинток (McClintock), Барбара, 268
МакроН2А, 259, 323, 472
Макронуклеусы
— активный vs. «молчащий» хроматин и, 135-135
— деление у инфузорий, 140-144
— индукция специфических делеций у инфузорий, 140-141
— определение, 130
— перестройки у инфузорий и, 131
— «спасение» наследуемых делеций в, 142-143
— фрагментация хромосом и, 138
М-делеционные элементы, 143-144
Медицина, трансплантация ядер и, 413-414
Межгенные повторы. См. Неточные делеции
Мейоз
— гетерохроматин и, 280-282
— зародышевых клеток эпигенетические механизмы и, 376
— процесс, 264-265, 288, 290
— хромосомная наследственность и, 264-265
Мейотический дрейф, 277-278, 280-282
Мейотический сайленсинг неспаренной ДНК (MSUD)
— RNAi и, 156
— у C. elegans, 296
— у Drosophila, 283
у Neurospora crassa, 117, 122-124, 282-283
— у мышей, 283
Меллер (Muller, H.J.), 303
Менделевская наследственность, 34-35, 133, 187
Метил-CpG-связывающиеся белки
— 5-метилцитозин, 448-449
— метилирование и, 51, 178-179, 341 -342
— репарация ДНК и, 343
— репликация ДНК и, 341-342
— Ретта синдром и, 342-343, 432-434
— сводка функций, 342
— транскрипционный контроль и, 343
— функция, 334
Метилентетрагидрофолат редуктазы недостаточность, 435
Метилирование. См. также
Метилирование ДНК
— — В-клеток развитие и, 392-395
— MSUD и, 122-123
— PRC2 и, 218
— RIP и, 119-120
— trxG белки и, 242
— Х-инактивация и, 318, 325
— аномальное у клонированных эмбрионов, 416
— аргининов, 47, 201-202
— болезни и, 435
— в трофоэктодермальных клетках, 380
— гетерохроматиновый сайленсинг у Drosophila и, 95-96
— гипотеза гистонового кода и, 19
— исторические симпозиумы, 15-17
— история эпигенетики и, 28
— кластеры импринтированных генов и, 359-360
— контроль у Neurospora, 120-121
— модификации гетерохроматина, 163
— модификации гистонов и, 40, 47, 135
— «молчащий» хроматин и, 254
— наследуемость, 334
— неопластическая трансформация и, 60-61
— общий обзор, 50-51, 196-202
— определение, 34
— отсутствие у S. pombe и, 108
— поддержание, 118, 120, 178, 335, 361
— распределение репрессированной ДНК и, 138
— регуляторы у растений, 53, 177-178
— репарация ДНК и, 267
— репликация ДНК и, 30
— сайленсинг растений и, 53
— сайты в гистоновых «хвостах», 41
— транскрипционный контроль и, 236
— у Neurospora crassa, 117-119
— функция, 34
— эпигенетическая регуляция у Arabidopsis к, 174
Метилирование denovo, 177-178, 186-187, 335-337
Метилирование ДНК
— CpG-островки и, 455-456
— N. crassa и, 107
— siRNAs и, 154
— Х-инактивация и, 325
— аллельное исключение, 396-398
— болезни и, 424-426, 430-431
— в ICM клетках, 379
— в эмбриональных стволовых клетках, 380
— веб-сайты с информацией о, 465
— внешняя среда и, 345, 438-439
— геномный импринтинг и, 354, 360-362
— ингибиторы, 459-460
— картирование, 338
— клеточная память и, 334-335
— мутации и, 343-344
— происхождение паттернов, 335-340
— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 375
— раковые заболевания и, 446, 448-449, 452, 459
— регуляция экспрессии генов, 340-343
— репрограммирование и, 378-379
— у млекопитающих, 334
— у растений, 170
— хромосомная стабильность и, 344
Метилирование, индуцированное премейотически (MIP) 120, 156
Метилтрансфераз (МЕТ1) семейство. 178
Метилтрансферазы. См. также ДНК-метилтрансферазы (DNMTs);
Метилтрансферазы лизинов гистонов (HKMTs)
— de novo, 335-336
— Х-инактивация, 325
— болезни и, 435
— метилирование аргининов и, 47, 201-202
— модификации гетерохроматина и, 162-164
— модификации гистонов и, 121-122, 235, 388
— поддержание у млекопитающих, 335
— РНК и, 51-53, 177-178, 186-187
— у растений, 177-179
Метилтрансферазы аргининов белков (PRMTs) 47, 61, 201-202
Метилтрансферазы ДНК (DNMTs)
— H3K9 метилирование и, 198-200
— ICF синдром и, 434
— RIP и, 119-120
— геномный импринтинг и, 361, 377
— гомология у 118
— защита CpG-островков и, 339
— ингибирование, 459
— исключение из ядра, 378-379
— метилирование и, 50
— млекопитающих, 335
— подавленней, 121-122
— полуметилированная ДНК и, 335
— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 375
— раковые заболевания и, 61, 449, 459
— у Drosophila, 97
Метилтрансферазы лизинов гистонов (HKMTs)
— В-клетки и, 398-399
— CpG метилирование и, 339
— Drosophila и, 37 Ezh2 и, 200, 224, 325, 388, 394
— MLL как, 233, 235
— SET домены и, 236
— SUVH белки и, 101
— trxG белки и, 235
— варианты гистонов инфузорий и, 135
— компенсация дозы и, 310
— метилирование ДНК у N. crassa и, 121
— модификации гистонов и, 47
— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 373
— раковые заболевания и, 61, 388
— репарация ДНК и, 267
— РНК-полимераза II и, 198
— сайленсинг и, 95-96
— у растений, 179
— формирование гетерохроматина и, 109-110
Метилтрансферазы с перестроенными доменами (DRM), 178, 186
Методы лечения, эпигенетические, 459-461
Миелоидные клетки, 390, 459
Миелоидный диспластический синдром, 459
Микроиньекция, 408
Микрококковая нуклеаза, 89-90, 110
Микронуклеусы, 130-132, 135-138, 140-141
МикроРНК, 377
Микрочипы, 338, 451
Минус (-) тип спаривания, 108
Митоз, 264-265, 273-276
Митотическая контрольная точка. См. Контрольная точка сборки веретена (SAC)
Млекопитающие
— trxG белки у, 235-236
— веб-сайты с информацией о, 467
— геномный импринтинг у, 349-365
— изменения, ассоциированные с репрограммированием ядер у, 416-417
— компенсация дозы у, 288, 313-330
— организация генома, 54
— получение из терминально-дифференцированных клеток, 411-414
— процедуры пересадки ядер для, 406-409
— репрограммирование у, 369, 371
— фенотипы клонированных. 410-411
— формирование неоцентромер у, 272
Модели распознавания, RNAi и, 160-161
Модельные системы, 36-38, 170-171
Модификации, 60-61, 317. См. также Модификация гистонов; Конкретные процессы
Модификация гистонов В-клетки, 398-399
— CpG-островки и, 455-456
— PcG и trxG и, 54-57, 231-232
— RAG2 и, 395
— Х-инактивация и, 296-298, 325-327
— геномный импринтинг и, 353-354, 362
— конститутивный vs. факультативный гетерохроматин, 323-325
— ломкой Х-хромосомы синдром и, 436-437
— общий обзор, 36, 46-48, 192
— репрограммирование
— сперматозоидов и, 377-378
— сайленсинг у C. elegans и, 296-98
— сайленсинг у Drosophila и, 95-96
— сайленсинг у S. pombe и, 108
— сайты для, 41
— сокращение локуса и, 395-396
— сперматогенез и, 298 т
— аблица, включая ссылки, 468-473
— темы в, 203-205
— транскрипционные факторы и, 388
— утрата отцовской хромосомы и, 281-282
— центромерный хроматин и, 274-275
— энзимы для модификации у растений, 178
— эпигенетическая регуляция у Arabidopsis и, 174
Мозаицизм, обусловленный эффектом положения (PEV)
— Drosophila и, 27, 37 ТРЕ и, 269
— исторические симпозиумы и, 14-15
— общий обзор, 90-91, 101
— определение, 88
— супрессия, 269
— Х-инактивация и, 88
— хромосомные белки, 90-91, 97-98
«Молчащие» кассеты, типы спаривания и, 75-77
— исторические симпозиумы и, 15
Мутагенез, 173, 176, 344
Мухи-сциариды, 281
Мыши
— Blimp 1 и, 372-374
— MSUD у, 283
— PcG гены у, 220
— Х-инактивация у, 317-318, 329
— веб-сайты с информацией о, 467
— геномный импринтинг и, 350-351, 356
— исследования раковых заболеваний и, 452
— как модельный организм, 37
— организация генома, 54
— получение моноклональных из зрелых клеток, 412-413
— ранняя детерминация зародышевых клеток у, 372
— регуляция функции теломер у, 269-270
— сайленсинг у, 283
— со «шпилечными» хвостами, 350-351
Н
Нанохромосомы, 138
Наследственность, 34, 82-83, 133-134, 187-188. См. также Цитоплазматическая наследственность
Негенетические различия, примеры, 35
Независимая от репликации (RI) сборка нуклеосом, 250-251
Независимый от оплодотворения эндосперм (fie), 215
Нейральные стволовые клетки (NSC). 225
Нейроны, 30, 412-413, 434-435
Нейротрофный фактор из мозга (Bdnf), 343
Неклеточно-автономный сайленсинг 184
Некодирующие РНК
— siRNAsH, 112
— Х-инактивация и, 317
— болезни и, 430
— геномный импринтинг и, 359-362
— гетерохроматинизация и, 53
— компенсация дозы и, 307-309
— сперматогенез и, 377
— функция, 34, 425-426
Неопластическая трансформация, 35, 60-61, 224, 452-453. См. также Раковые заболевания
Неоцентромеры, 272, 276-277
Неслучайная Х-инактивация, 324, См. также Импринтированная Х-инактивация
Неспаренная ДНК, 282-283
Неточные делеции, 137-138
Нокауты, 37, 124, 135, 270, 379-380
Нуклеазы, 71, 74, 89-90, 110
Нуклеосомы
— CENP-A и, 274-275
— H3K36 метилирование и, 197-198
— trxG белки и, 240-241
— архей vs. эукариот, 248-250
— ацетилирование и, 194
— исторические симпозиумы и, 15
— определение, 39
— ремоделинг хроматина, 49
— структура, 40
О
Облегчение транскрипции хроматина (FACT), 49, 204
Оболочки ядра, 81-82
Обонятельные нейроны, 30, 412-413
Общие миелоидные прогениторы (CMPs), 390
Овцы, клонирование, 407-408
Ограничение по калориям, 84
Однонуклеотидные полиморфизмы (SNPs), 353
Однородительская дисомия, 424, 427-428
Окно возможностей, 329
Онкогенез, 18, 60-61, 235. См. также Раковые заболевания
Ооциты
— IАР ретротранспозон у 377
— асимметричное распределение и, 377
— деметилазы ДНК и, 417
— млекопитающих, 369-370
— процедуры ядерных пересадок и, 406-407, 417-418
Оплодотворение, 131-132, 170, 378
Опухоли, 35, 60-61, 224, 362, 452-455. См. также Раковые заболевания
Организация генома
— веб-сайты с информацией, 466-467
— гетерохроматин и, 45 сравнение, 54
— эпигенетический контроль и, 62
Остановки, Х-инактивация и, 327
Острая миелоидная лейкемия, 447
Острая промиелоцитарная лейкемия. 56, 447
Осы, утрата отцовских хромосом у, 281-282
Отбор, 34, 315, 321
П
Память, 20. См. также Клеточная память
Парамутация, 14, 30, 35, 177, 187
Паратиреоидизм, 431
Партеногенез, 355-356, 369
Первичная неслучайная
Х-инактивация, 321, 324
Перекрестное оплодотворение, 131
Перемещаемые элементы. См. также Ретротранспозоны
— N. crassa и, 116
— P-элементы как, 89 RIP и, 123-124
— RNAi у растений и, 186
— геномные перестройки и, 139-140
— геномы млекопитающих и, 53-54
— исторические симпозиумы, 21, 27
— метилирование ДНК и, 50
— модификации гетерохроматина и, 164
— «нацеливание» формирования гетерохроматина и, 99-100
— неопластическая трансформация и, 59-60
— растения и, 36, 184
— ремоделинг хроматина и, 163, 364
— сайленсинг и, 53
Перестройки, 133, 138-139, 272
Перицентромерные фокусы, 56
Петунии, 153, 156, 173, 177
Пиримидиновые димеры, 267
Плазма, Blimp 1 и, 372-374
Плазматические клетки, 398-400
Плазмодесмы, 172
Пластичность, 54, 56, 59, 400-401
Плейогомеотические (РНО) белки, 220
Плече-лопаточно-лицевая миопатия, 436-437
Плюрипотентность
— лимфоциты и, 390
— определение, 369
— развитие лимфоцитов и, 390
— развитие примордиальных зародышевых клеток и, 372-374
— развитие стволовых клеток и, 379-382
— репрограммирование и, 58-59, 381-382 сперматогенез и, 376
Плюрипотентные стволовые клетки, 379-382
Плюс (+) тип спаривания, 108
Повторяющиеся элементы, 54, 108-109, 111-112, 137
Подавление, 116, 121-122
Подвижные генетические элементы. См. Перемещающиеся элементы
Поддержания минихромосом (МСМ) белки, 266
Поддерживающее метилирование, 120, 178, 335, 361
Подобные плейогомеотическим (PHOL) белки, 220
Полигомеотические (PH) белки, 219
Полимеразы, 186. См. также конкретные PH К-полимеразы
Полиплоидия, 170, 172
Политенные хромосомы, 35
Полицентричные хромосомы, определение, 265
Половое воспроизведение, преимущества, 314-315
Половые тельца, 257
Посттранскриппионный сайленсинг генов (PTGS). См. также RNAi
— Drosophila и, 99
— RNAi-опосредованный сайленсинг у растений и, 182-183
— деградация РНК и, 52
— дробянковые дрожжи и, 113
— как эквивалент RNAi у растений, 177
— общий обзор, 153
Посттрансляционные модификации
— ацетилирование, деацетилирование и, 193-195
— гистоны и, 192-193
— деиминирование, 47, 202, 379-380
— метилирование и, 196-202
— темы в, 203-205
— убиквитинирование, сумоилирование и, 202-203
— фосфорилирование и, 195
Почкующиеся дрожжи. 74-77. См. также Saccharomyces cerevisiae
Прадера-Вилли синдром, 427-430
Пре-BCR, 397
Превращение пола, 281-282
Пререпликационный комплекс 2 (PRC2)
— Х-инактивация и, 325, 327
— геномный импринтинг и, 223
— деацетилазы гистонов (HDACs) и, 215
— развитие растений и, 217
— ремоделинг хроматина и, 218
— ретинобластомы (Rb) белки и, 224-225
Преформизм, 369, 372
Примордиальные зародышевые клетки
— Blimp 1 и, 372-374, 398-400
— Х-реактивация, 329
— детерминация, 372
— плюрипотентные, 369, 374-375
— плюрипотентные клеточные линии из, 380-381
— развитие, 372-374
Прионы, 19, 21, 31, 34
Проблемы исследований, 64-65
Прогениторы Гранулярных Нейронов Мозжечка (CGNPs), 225
Прогерия, 56
Продолжительность жизни. См. Старение
Происхождение распознающих комплексов (ORC), 75-76, 78, 80, 266, 269
Пролиферация, 55, 223-225
Промоторы, CpG-островки и, 339
Протоперитеции, 116
Процесс репликации ДНК
— MBD1 и, 341-342
— варианты гистонов и, 49
— контроль, 266-267
— метилирование и, 30
— откладка гистонов и, 250-251
— ретротранспозоны и, 268
— у растений, 182
Псевдоаутосомный район. 317
Псевдогипопаратиреоидизм, 428, 431
Псевдокинетохоры, 282
Психические болезни, внешняя среда и, 425
Пузырьки, 266
ПЦР, 338, 459
Р
Рабдомиосаркома, 430
Развитие
В-клеток, 390-392
PcG-репрессия и, 218-219, 223-226
история эпигенетики и, 27
метилирование ДНК и, 337-338
органа из одной клетки, 388-390
регуляция X-инактивации у млекопитающих и, 317
репрограммирование и, 417
Размеры геномов, 54
Разнообразие. См. Разнообразие антител
Раковые заболевания
— CpG-островков метилирования, 339
— H3K27 метилирование и, 200
— MLH1 ген и, 437, 450, 453-454
— PRC комплексы и, 57, 219-223
— trxG гены и, 223, 235
— гиперметилирование и, 61, 449-452
— деметилазы и, 200
— исторические симпозиумы и, 18
— метилирование ДНК и, 334, 344.
— 448-449, 459
— метилтрансферазы и, 61, 388, 449, 459
— обзор, 60-61
— причины их, 446-447
— сайленсинг и, 452-458
— темы исследований, 458
— трансплантация ядер и, 413-414
— хроматин и, 447-448
— эпигенетические методы лечения, 459-461
Распространение гетерохроматина, 79-80, 88-89, 96-97
Распространения и отступления модель, 327
Растана модель блокирующего фактора, 320-321
Растения. См. также Arabidopsis RNAi-опосредованного сайленсинга пути, 182-187
— выгоды от использования для исследований, 170-177
— геномный импринтинг и, 350
— жизненный цикл, 172
— как модельные организмы, 36
— молекулярные компоненты хроматина у, 177-182
— не-РНК эпигенетическая регуляция, 187
— участие PRC2s в развитии, 217
— эволюция центромер у, 276
— эпигенетическая регуляция у, 170
Реверсия, 20
Регулятор гистонов A (HIRA), 275, 378
Регуляторы «Молчащей» Информации (SIR)
— белки ацетилирование гистонов и, 80
— ацетилирование, деацетилирование и, 79-80, 195, 198
— гетерохроматиновая репрессия и, 75-77
— деацетилирование гистонов и, 78-79
— заякоривание гетерохроматина и, 83
— исторические симпозиумы и, 17-19
— как пример, 36
— «молчащий» хроматин и, 78
— репрессия и, 75, 77-80
— старение и, 83-84
— структура семейства, 75-76
— теломерный эффект положения (ТРЕ) и, 79
— ядерная локализация, 81-82
Рекомбинация, 72, 355, 388, 382-395
Релокализация, генов
иммуноглобулинов, 395
Ремоделинг хроматина
— В-клетки и, 398-399
— PRC2 и, 218 trxG
— белки и, 236-240
— Xist и, 57
— АТФ-зависимые комплексы, 42, 49, 233, 237-240, 309
— белки ремоделинга хроматина у растений, 181
— болезни и, 34
— варианты гистонов и, 49-50
— исторические симпозиумы и, 29
— компенсация дозы и, 303-306
— метилирование ДНК и, 340
— неопластическая трансформация и, 59-60
— определение, 34
— перемещающиеся элементы и, 364
— разнообразие рецепторов антигенов и, 392-395
— транскрипционный контроль и, 204
— факторы ремоделинга и, 49
— эпигенетическая регуляция у Arabidopsis и, 174-175
Ремоделинга хроматина комплексы, 49-50
Репарация ДНК
— Н2АХи, 255-257
— MBD4 и, 343-344
— раковые заболевания и, 446
— структура хроматина и, 267-268
Репликационного Белка А комплекс, 181
Репликация. См. Процесс репликации ДНК
Репортерные гены, дрожжи и, 72-73, 75
Репрессия. См. также Polycomb репрессивные комплексы
— В-клеток развитие и, 392, 399
— Вс16 и Blimp1 и, 399-400
— LSD1 и, 200
— SIR-белка концентрация и, 79-80
— trxG белки и, 243
— выпетливание теломер и, 80-81
— гетерохроматина, 75-77
— консерватизм, 374-375
— метилирование ДНК и, 340-344
— метилирование и, 199-200
— модификации гистонов и, 192
— сумоилирование и, 202-203
— типы спаривания дрожжей и, 75-77
Репрессор сайленсинга (ROS1), 178
Репрессор-активатор-белок 1 (Rapl), 77-80
Репрограммирование. См. также Трансплантация ядер в клонах, 409, 416
— общий обзор, 58-59
— от зиготы до бластоцисты, 379
— плюрипотентность и, 58-59, 375-376, 381-382
— после оплодотворения, 378
— потенциал для тотипотентности и, 412
— состояние дифференцировки донорской клетки и, 411-413
— стабильность Х-инактивации, 328-329
— стволовых клеток, 381-382
— тотипотентность и плюрипотентность, 369
— у амфибий, 414-416
— у млекопитающих, 416-417
Репродуктивное клонирование, 418-421
Рестрикционные энзимы, 338
Ресурсы и базы данных по геномам организмов, 466-467
Ретинобластомные (Rb) белки, 224-225
Ретродифференцировка, 411
Ретротранспозоны, 44. 94, 271, 385, 387
Ретта синдром, 334, 342-343, 432-434
Рецепторы ростового фактора, 235
РНК-зависимая РНК-полимераза (RDRP), 52, 123, 155, 162, 282, 295
РНК-зависимый сайленсинг у C. elegans, 283
РНК-индуцируемый сайленсирующий комплекс (RISC), 154, 183, 185
РНК-индуцируемый эффектор транскрипционного сайленсинга (RITS), 110, 112, 114, 154, 158-161, 199, 437
PHК - метилтрансферазы, 51
РНК-направляемое метилирование ДНК(RdDM), 52-53, 183, 186-187
РНК-направляемое РНК-полимеразный комплекс (RDRC), 114, 159-161
РНК-нокдаун. См. Посттранскрипционный сайленсинг
РНК-полимераза, 162-163, 165, 175
РНК-полимераза II
— H3K36 метилирование и, 197-198
— H3K4 метилирование и, 196-197
— HKMTs и, 198 PcG белки и, 243
— факторы, влияющие на элонгацию, 204
— центромерные повторы и, 113
РНК-полимераза IV, 53, 186-187
Родительские геномы, 338
Родительский импринтинг. См. Импринтинг
Родительского конфликта теория, 181, 356
Рост, регуляция геномным импринтингом, 355
Ростовые сигналы, раковые заболевания и, 446
Рубинштейна-Тайби синдром, 432
С
Сайленсерные элементы, 75-77
Сайленсинг генов. См. Сайленсинг
Сайленсинг у инфузорий и источники 154
Сайленсинг у инфузорий и теломеры и 52
Сайленсинг у инфузорий и 139
Сайленсинг. См. также Компенсация дозы; Посттранскрипционный сайленсинг; RNAi; Транскрипционный сайленсинг генов (TGS); Индуцируемый вирусом сайленсинг генов; Х-инактивация
— PcG и trxG и, 55, 57, 223
— PRC1 и, 223 RNAi и, 36, 52-53, 139
— Х-инактивация как, 314
— Х-хромосом у C. elegans, 289, 296-298
— аккумуляция в Xi, 326
— белки кинетохорных доменов и, 110-111
— в центромерах дробянковых дрожжей, 108
— геномный импринтинг и, 353-365
— гетерохроматин и, 40, 88-90
— движение экспрессируемых генов и, 44
— зависимый от гомологии у инфузорий, 139
— избыточность и, 329
— исторические симпозиумы и, 17
— компенсация дозы и, 287-288
— ломкой Х-хромосомы синдром и, 436-437
— мейотический посредством неспаренной ДНК (MSUD), 122-123
— метилирование ДНК и, 340-344
— метилирование и, 51-52
— механизмы, 115-116, 177
— модификации гистонов и, 95-96
— наследование измененного
— расположения ресничек у, 27, 133-134
— неклеточно-автономный, 184
— паттерны в теломерах, 80
— посредством неспаренной ДНК во время мейоза, 282-283
— раковые заболевания, 452-458
— растения и, 53
— субнуклеарная релокализапия и, 395
— температура и, 90
— транскрипция неспаренной ДНК и, 282-283
— у S. pombe, 108
— формирование субкомпартментов и, 83
— хромосомные белки и, 90-93
— центромерные внешние повторы и, 111-112
— эпигенетика и, 31
Сателлитная ДНК, ICF синдром и, 434-435
Сверхчисленные половые гребешки (ESC), 215, 296-297
Сдержек и противовесов механизм, 329
Сегрегация
— CenH3 и, 252-253
— H2AZ и, 258
— ахиазматическая, 278-280
— в мейотическом процессе, 278-281
— гетерохроматиновое спаривание и, 270-281
— нормальная, 265
— результаты аномальной, 264
— у Drosophila, 279-281
— утрата гетерохроматина, 115, 156
Серотипы, 133
Сигналинг, лимфопоэз и, 400-403
Сигнатуры, модификации гистонов и, 46
Силвера-Рассела синдром, 428, 431
Синаптонемные комплексы, 277-278
Сканирования генома модель. См. scnRNA модель
Сканирования транскриптома модель, 147-148
Случайная Х-инактивация, 319-321
Сниженное метилирование ДНК 1 (DDM1), 161-162, 179, 348
События мозаичной экспрессии. См. Мозаицизм, обусловленный эффектом положения
Сокращение локуса, 395-396
Соленоидные модели организации хроматина, 43
Сомаклональная изменчивость, растения и, 172, 188
Соматическая гипермутация, метилирование и, 51
Соматические DMRs, геномный импринтинг и, 361
Соматические клетки, 27-28, 141-144, 405-409
Соматическое репрограммирование.
См. Репрограммирование
Соннеборн (Sonnebom, Т.М.), 131-132
Состояние покоя, репрограммирование и, 58-59
Сперматогенез
— Н2АХ и, 257
— IAP ретротранспозон в, 378
— Х-инактивация и, 319-320
— геномный импринтинг и, 354
— гетерохроматиновые сайты спаривания и, 278-279
— гиперконденсация во время, 298
— замещение гистонов и, 260
— эпигенетическая модификация во время, 376-377
Специфичных для мужского пола летальных (MSL) генов комплекс, 303-309
Спиротрихи, 138
Споруляция, 74
Старение, 56, 83-84, 362, 438
Стволовые клетки, 54-55, 225-226, 379-382. См. также Эмбриональные стволовые клетки «
Стебель-петля»-связывающийся белок (SLBP), 250
Стихотрихи, 137
Структурная наследственность. 133-134
Субероиланилид-гидроксамовая кислота (SAHA), 460
Субтрактивные методы, 451
Судьбы. См. Соматическое репрограммирование
Сумоилирование, 192, 202-203, 354
Сумчатые, 51, 276, 316-318, 328, 355-356
Супрессорные гены, раковые заболевания и, 449-450
Сцепленная с Х-хромосомой адренолейкодистрофия, 425
Сцепленная с Х-хромосомой задержка умственного развития, 434
Сцепленные с Х-хромосомой гены, возможные способы уравнивания для, 316-317. См. также Компенсация дозы
Т
Талассемии, 421, 432, 434-436
Теломера-ассоциированные последовательности (TAS), 99, 112, 268
Теломеразы, 78, 268
Теломерный эффект положения, 72, 93, 269
Теломеры
— Drosophila и, 99
— siRNAs и, 53
— trans-взаимодействие, 81-82
— выпетливание, 80-81
— исторические симпозиумы и, 17
— контроль структуры и функции, 268-269
— репрессия и, 82
— сборка, 78
— функция, 44
— хромосомная наследственность и, 266
Температура, сайленсинг и, 90
Терапевтическое клонирование, 418-421
Терапия с использованием трансплантации ядер, 418-421
Терминальный цветок 2 (TFL2), 182
Тесты с иммунопреципитацией хроматина (ChIP), 17, 20, 48, 193, 197, 199, 201
Типы спаривания (МАТ). См. также Коньюгация
— N. crassa, 116
— RNAi и, 158
— S. pombe и, 108
— инфузории, 133, 143
— переключение, 36, 74-75
— эпигенетический контроль репрессии, 75-77
Титин, 242
Т-клеток развитие, 388
Токсины, Caedibacter, 133
Токсины, P. aurelia, 133
Толстой кишки рак, 451, 453-455
Тотипотентность, 54, 369, 412
Точные делеции, 137
Транзитивность, 184
Транс-активные siPHK (ta-siRNAs), 186
Трансгеном индуцируемый сайленсинг, 139-140
Трансдетерминация. 212
Транскрипционная интерференция, 364
Транскрипционная память. См. Клеточная память
Транскрипционного фактора (TF) размещение, 46
Транскрипционные факторы
— Rapl, 77-80
— SWI/SNF-комплексы как, 239-240
— trithorax (trxG) белки как, 243
— trxG белки как, 243
— варианты гистонов у инфузорий, 135
— интерференция метилирования ДНК с, 340-341
— лимфопоэз и, 389, 390-392
— модификации гистонов и, 192
— роль в эпигенетическом контроле. 390-392
Транскрипционный контроль, 257-258, 343
Транскрипционный сайленсинг генов (TGS). См. также ДНК и метилирование гистонов
— Alcohol dehydrogenase (Adh) трансгены и, 99
— PcG-комплексы и, 219-223 RNAi и, 112
— RNAi-опосредованный сайленсинг у растений и, 182-183
— Х-инактивация, 323-324
— гетерохроматин и, 52
— общий обзор, 153-154
Транскрипция
— Вс16 и Blimp 1 и, 398
— PRC1 и, 219
— SWI/SNF-комплексы и, 236-239
— trithorax (trxG) белки и, 242
— trxG белки и, 235-236
— аберрантная активация, 224-225
— ацетилирование и деацетилирование и, 193-195
— внутренний элиминируемый сегмент (IES) и, 53
— выравнивание генных продуктов и, 302, 305-306
— зависимая от метилирования репрессия, 343
— изменения в структуре хроматина и, 204-205
— изменения у с репрограммированием, 414-417
— метилирование ДНК и, 340
— механизм, 302
— модификации гистонов и, 40
— регуляция гистонами и ацетилированием, 193-195
— сайленсинг и, 52-53
— эухроматин и, 45
Транслокации, 327-328, 350-351, 447
Трансплантация ядер
— геномный импринтинг и, 352
— изменения, ассоциированные с, 414-417
— медицинские следствия, 418-421
— процедуры для, 406-409
— раковые заболевания и, 413-414
— соматическое репрограммирование и, 58-59
— фенотипы клонированных животных и, 409-414
— эпигенетическая память и, 417-418
Трансформирующая ДНК, 121 -122
Трихлоростатин A (TSA), 113, 115, 121, 325, 328-329
Трихогины, 116 тРНК, 109
Трофобласта защиты теория. 356
Трофэктодермы (ТЕ) слои, 371-372, 379-380
Т-хелперные клетки, 338, 343
Тэйтум и Бидл (Tatum, Beadle), 116
У
Убиквигин ЕЗ лигаза (UBE3A), 429, 454
Убиквитинирование
— Х-инактивация и, 324-325, 328
— общий обзор, 192, 202-203
— репарация ДНК, 267, 446
— сайты в гистоновых «хвостах», 41
Уилмса опухоли, 430. См. также Прадера-Вилли синдром
Упаковка, 248
Урацил-ДНК-гликозилазы, 343
Уремия, 438
Утрата гетерозиготности, 452
Утрата импринтинга (LOI), 60, 452
Утрата октамера, 204
Ф
Фактора Сборки Хроматина (CAF) комплекс, 83, 181, 250-251, 275, 378
Фактор-A специфичности расщепления-полиаденилирования (CPSF-A), 162
Факторы связывания, защита CpG-островков и, 339
Факультативный гетерохроматин, 40, 57-58, 323-325, 327
Фибробласты, 407, 411 Фолат, 435, 438
Фосфатазы (РРТазы), 42, 97
Фосфоинозитол 3-киназа-подобных киназ семейство, 255
Фосфорилирование, 40, 195-196, 255-257
Фотопериода путь, 216
Фотопериод-независимое раннее цветение (PIE), 181
Фрагментация. См. Фрагментация хромосом
Фрагментация хромосом, 138
X
Хиазматическая сегрегация, 278
Химеры, растения и, 172 «Храповик Меллера», 315
Хроматин. См. также «Молчащий» хроматин
— ICF синдром и, 434-435
— PcG и trxG и, 55-57
— Т-клеточные рецепторы (TCR) и 388
— trxG белки и, 236-242
— Х-инактивация и, 322-325
— Xist ген и, 322
— АТФ-зависимые комплексы ремоделинга и, 235
— болезни и, 426 в центромерах, 272-275
— веб-сайты с информацией о, 465
— влияние RNAi на структуру, 158-165
— влияние структуры на транскрипцию, 204-205
— ДНК vs., 40
— изменения при репрограммировании, 415
— история эпигенетики и, 14, 18, 34
— как матрица, 39-40
— клеточная память и, 63-65
— ломкой Х-хромосомы синдром и, 426, 436-437
— метилирование ДНК и, 339-340
— модификации гистонов, 49-50, 192
— молекулярные компоненты у растений, 177-182
— недостаточность по метилентетра-гидрофолатредуктазе и, 435
— общий обзор, 34, 38, 192 определение, 191
— организация, 39-44 плече-лопаточно-лицевая миопатия, 437
— раковые заболевания и, 447-448
— Ретта синдром и, 432-434
— Рубинштейна-Тайби синдром и, 432
— талассемии и, 435-436 функция, 34
— Шимке спондилоэпифизарная дисплазия и, 435
— эпимутации и, 437
— эухроматин vs. гетерохроматин и, 44-46
Хроматоидные тельца, 377
Хромодомены
— H2AZ и, 258
— H3K36 метилирование и, 197-198
— ORF «нацеливание» и, 195
— PcG и trxG и, 55, 218, 220
— компенсация дозы и, 304-305
Хромометилазы, 178
Хромосомных разрывов последовательности (CBS), 137-138
Хромосомы. См. также Сегрегация аномальная, 264
— изменения при репрограммировании, 415
— метилирование, 51
— метилирование ДНК, 343-344
— механизм наследования, 264-266
— «нацеливание» компенсации дозы», 307-309
— обзор организации, 35 организация, 314
— перестройки, 272
— полиплоидия и, 170
— политения, 35
— последовательности вздутий, 282
— разрывы хромосом и болезни, 434-435
— распределение trxG белков, 239
— родительская утрата, 281-282
— родительское происхождение и, 16
— стабильность, 344
— фрагментация у инфузории, 138-139
— эволюция Y-хромосомы, 315
— элементы, необходимые для наследования, 264-266
Ц
Цветение, яровизация и, 216-217
Центромерные внешние повторы, сайленсинг и, 111-112
Центромеры H3-варианты и, 252-254
— ахиазматическая сегрегация и, 278-280
— регуляция идентичности, 276
— состав у дробянковых дрожжей, 113-115
— структура, функция и воспроизведение. 275-276
— функция, 44
— хроматина состав в, 272-275
— хромосомная наследственность, 265
— эволюция, 276-277
— эукариотная структура и функция, 270-271
Цикл «разрыв-слияние-мостик», 268
Цитозин
— дезаминирование, 51, 388, 398
— метилирование и, 51, 177-178, 334-335
— раковые заболевания и, 448-449, 459
— Цитоплазматическая наследственность
— scnRNA модель и, 147
— менделевская наследственность vs., 133
— перестройки ресничек, 142-143
— серотипов, 133
— сканирования транскриптома модель и, 147-148
— следствия, 144
— у инфузорий, 132-133, 142-143
Цитоплазматические мостики. См. Плазмадесмы
Цитруллин, 202
Ч
Человеческие искусственные хромосомы (HACs), 271
Членистоногие, геномный импринтинг и, 350
Чужеродные последовательности, элиминация, 142-143
Ш
Шапероны, 83, 378
Шимке спондилоэпифизарная дисплазия и, 432, 435
«Шму» (Schmoos) [форма клеток у дрожжей], 73
«Шпилечная» РНК, 159
Э
Эволюционно консервативные хромосомные сегменты (ECCS). 254. См. также Адаптивная эволюция
Экспрессия
— PcG-гена сверхэкспрессия и, 224
— ацетилтрансферазы гистонов (HATs) и, 29
— в В-клетках и плазматических клетках, 400-401
— геномный импринтинг и, 349-350
— импринтированных генов, 223-224
— клонирование и, 417
— контроль в лимфоцитах, 392
— локализация и, 20
— программы развития и, 377-379
— регуляция метилированием ДНК, 340-343
— регуляция Х-хромосом, 290
— эмбриональной эктодермы (Eed), 223
Экстраклеточный сигналинг, 390
Эксцизии. См. Внутренние
элиминируемые сегменты
Элементы контроля импринтов, 357-359
Элементы повторов, 81
Элонгация, PcG-сайленсинг и, 58
Эмбриогенез, 58, 322
Эмбриональные зародышевые клетки, плюрипотентные, 369
Эмбриональные стволовые клетки генерирование, 379-380
— использование в терапии, 418, 420
— метилирование de novo и, 335
— от ядерных пересадок (NT-ES), 418-421
— плюрипотентные, 369, 376, 379-382
— соматическое репрограммирование и, 58-59
— терапевтическое клонирование и, 418-421
Эмбриональный Цветок (EMF), 180, 216
Эмбрионы, 355-356, 406-407, 418
Эндонуклеазы, переключение типа спаривания и, 74-75
Энзимы, 18, 21, 29, 40, 46-48. См. также конкретные энзимы
Энхансеры
— zeste (E(Z)) семейство, 96, 179-180, 214, 224, 296-297
— аллельное исключение, 397
— мозаичности (E(var)), 90-92
— сайленсинг у C. elegans и, 296-297
Эпиаллели, 36, 177
Эпигенез, 369, 372
Эпигенетика, определение, 13, 27, 34, 38-39
Эпигенетическая память. См. Клеточная память
Эпигенетические импринты, определение, 298, 299
Эпигенетические методы терапии, для раковых заболеваний, 459-461
Эпигенетические состояния, определение, 38
Эпигенетический код, 38
Эпигенетический контроль, 62-64, 75-77
Эпигенетический ландшафт, развитие, 39
Эпигеномы, определение, 424
Эпимутации, болезни человека и, 437
Эписостояния, TSA-индуцированный сайленсинг и, 113
Эпифенотипы, 35
Эритроидные клетки, CMPs и, 390
Эссенциальный (Е) сайленсер, 77-78
Эстрогенный сигналинг, метилирование аргининов и, 201
Эухроматин
— H3K27 метилирование и, 200
— H3K4 метилирование и, 196-197
— H3K9 метилирование и, 198-200
— гетерохроматин vs., 44-46, 97, 100, 177
— «молчащий» хроматин и, 57
— определение, 34, 40, 71
Я
Ядерная организация, общий обзор, 20-21
Ядерная эквивалентность, 405
Ядерный диморфизм, 36, 131, 135-136
Ядрышковое доминирование, 177
Яйцеклетки, 377, 407, 417-418
Яровизация (VRN), 180, 188, 214, 216-217